On-line: Мамонт, гостей 4. Всего: 5 [подробнее..]
АвторСообщение
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 433
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 01.01.19 18:27. Заголовок: Неоцен под микроскопом


Я заметил, что в неоцене нет ничего о микроорганизмах.
Какова будет роль бактерий и архей через 25 миллионов лет?
Какие микробиомы почвы, воздуха, морской и пресной воды там будут?
Как выглядит нормальная микробиота неоценовых животных?
Все эти вопросы весьма интересно обсудить.

Предложу несколько идей:
1) Аспороклостридии и аспоробациллы - утратившие спорообразование за ненужностью.
2) Актиноаскомицеты и актинобазидиомицеты - актиномицеты со специализированными органами спороношения.
3) Воскобактерии - заменившие муреин на восковые вещества, потомки микобактерий.
4) Легуминобактерии - живут только в клубеньках бобовых, которые стали большими (как настоящие клубни) и усовершенствовались, а часть симбионтов поднимается по сосудам растения в семязачатки, чтобы передаться потомкам.
5) Новые формы симбионтов в нормальной микробиоте кишечника и других частей тела животных - характерные для каждого вида животного, независимо от "пришельцев" извне, передаваемые детенышам через грудное молоко или яйца.

Это только бактерии, грибы можно и нужно обсуждать отдельно.
В эту же тему можно все, что касается микроорганизмов (кроме грибов-макромицетов) в неоцене.

Спасибо: 1 
Профиль Цитата Ответить
Ответов - 114 , стр: 1 2 3 4 5 6 All [только новые]





Пост N: 3476
Рейтинг: 10
ссылка на сообщение  Отправлено: 02.01.19 00:18. Заголовок: Красота!..


Красота!

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 15488
Откуда: Россия, Москва
Рейтинг: 18
ссылка на сообщение  Отправлено: 02.01.19 00:29. Заголовок: А что насчёт конкрет..


А что насчёт конкретно болезней?

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 434
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 02.01.19 13:23. Заголовок: Мех пишет: А что на..


Мех пишет:

 цитата:
А что насчёт конкретно болезней?


В смысле? Болезни будут зависеть не только от возбудителей, но и от возможностей хозяина по части иммунитета. Это отдельный большой вопрос.

Чуть позже (завтра-послезавтра) выложу более подробные описания вышеуказанных идей.
Если удастся, из этого выйдет целая новая глава для "Путешествия в неоцен", потенциальное название которой - заголовок этой темы. Ну или иное, что Автор захочет.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 15490
Откуда: Россия, Москва
Рейтинг: 18
ссылка на сообщение  Отправлено: 02.01.19 17:36. Заголовок: Биолог пишет: В смыс..


Биолог пишет:

 цитата:
В смысле?


Ну, уже сейчас появилась уйма болячек, которых раньше не существовало - а после эпохи человека их останется ещё больше, как ни крути. Плюс могут появиться и другие группы тех же бактерий, перерабатывающих X в Y, например.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 437
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 02.01.19 18:11. Заголовок: Мех пишет: уйма бол..


Мех пишет:

 цитата:
уйма болячек, которых раньше не существовало


Да, но другие, наоборот, существовали еще до нашей эры и на сегодня почти не изменились. Да и новые - не все же сразу, эбола так вообще с 1950-х известна, желтая лихорадка - с 1970-х, и так далее.

 цитата:
после эпохи человека их останется ещё больше


Совсем не факт. Возбудители, специализировавшиеся только на людях, на животных не перейдут, а просто вымрут со своим единственным хозяином.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 15493
Откуда: Россия, Москва
Рейтинг: 18
ссылка на сообщение  Отправлено: 02.01.19 18:54. Заголовок: Биолог пишет: Да, но..


Биолог пишет:

 цитата:
Да, но другие, наоборот, существовали еще до нашей эры и на сегодня почти не изменились.


Но если в неоцене внезапно появились всякие аспоробациллы, воскобактерии и прочие зверятки, которых раньше не было - это "жжж" явно неспроста %)


 цитата:
Возбудители, специализировавшиеся только на людях, на животных не перейдут


Уже сейчас ведутся разработки, может быть не прямо такие, но человек активно одомашнивает микробов для самых разных задач, и появление чего-то более универсального - лишь вопрос времени.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 943
Рейтинг: 1
ссылка на сообщение  Отправлено: 02.01.19 20:12. Заголовок: Биолог пишет: Если ..


Биолог пишет:

 цитата:
Если удастся, из этого выйдет целая новая глава для "Путешествия в неоцен", потенциальное название которой - заголовок этой темы.


А вот это было бы очень интересно

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить



Пост N: 3477
Рейтинг: 10
ссылка на сообщение  Отправлено: 02.01.19 21:24. Заголовок: Мех пишет: человек ..


Мех пишет:

 цитата:
человек активно одомашнивает микробов для самых разных задач


"Домашние микробы" обычно вообще ни на что не годны в диких условиях.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 15494
Откуда: Россия, Москва
Рейтинг: 18
ссылка на сообщение  Отправлено: 02.01.19 22:17. Заголовок: Zenitchik пишет: ..


Zenitchik пишет:

 цитата:
"Домашние микробы" обычно вообще ни на что не годны в диких условиях.


Несомненно, так - но даже если из сотен тысяч искусственных штаммов уцелеет хотя бы 0,001 процента...

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить



Пост N: 3478
Рейтинг: 10
ссылка на сообщение  Отправлено: 02.01.19 22:19. Заголовок: Мех пишет: но даже ..


Мех пишет:

 цитата:
но даже если из сотен тысяч искусственных штаммов уцелеет хотя бы 0,001 процента...


Они совершенно затеряются на фоне диких видов. Ну, одним штаммом больше - одним меньше...

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 15495
Откуда: Россия, Москва
Рейтинг: 18
ссылка на сообщение  Отправлено: 02.01.19 23:16. Заголовок: Но у них могут оказа..


Но у них могут оказаться способности, которых нет у диких %) Скажем, некий условный микроб перерабатывает асфальтовые ямы в съедобную биомассу, вокруг которой вырастает сложная экосистема. Или бактерия, обученная жить среди облаков и соединяться в паутинки наподобие цианобактериальных матов.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить



Пост N: 3479
Рейтинг: 10
ссылка на сообщение  Отправлено: 03.01.19 01:50. Заголовок: У бактерий были милл..


У бактерий были миллиарды лет. Они понаизобретали такого - что не перестаёшь удивляться.
На счёт асфальта - не удивлюсь, если такие уже есть.
А на счёт облаков - если бы это было энергетически выгодно - они бы это как-нибудь делали.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 15501
Откуда: Россия, Москва
Рейтинг: 18
ссылка на сообщение  Отправлено: 03.01.19 05:35. Заголовок: Zenitchik пишет: У б..


Zenitchik пишет:

 цитата:
У бактерий были миллиарды лет. Они понаизобретали такого - что не перестаёшь удивляться.


И даже многоклеточными стали %) Но даже им есть, к чему стремиться. Например, та же устойчивость к антибиотикам, которая вполне могла бы появиться гораздо раньше, используй дикие звери всякие пенициллины для лечения.

Кстати, тоже тема - коль скоро человечество уже сейчас всерьёз задумывается о риске технологий, позволяющих пилить хтонические вирусы буквально на коленке, и соответствующей угрозе потенциально для всей биосферы, можно даже если не в Неоцен, то куда-то ещё запилить, допустим, специальный быстроэволюционирующий лишайник, предназначенный для борьбы со всё более изощрёнными штаммами болячек, дабы те не выкосили всё живое под корень. То есть он спроектирован так, чтобы вырабатывать лекарства и не терять полезные качества в ходе естественного отбора - например является симбионтом животных, котоыре его поедают, и вынужден помогать им справляться с заразой. Просто как идея. Получится весьма перспективное поле для творчества.


 цитата:
На счёт асфальта - не удивлюсь, если такие уже есть.


Навряд ли, иначе о них бы уже было слышно ¯\_(ツ)_/¯


 цитата:
А на счёт облаков - если бы это было энергетически выгодно - они бы это как-нибудь делали.


Ну, собственно говоря, бактерии там и так успешно живут, только поодиночке. Но они вообще миллиарды лет не помышляли ни о каком многоклеточном существовании.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить



Пост N: 3480
Рейтинг: 10
ссылка на сообщение  Отправлено: 04.01.19 16:46. Заголовок: Мех пишет: та же ус..


Мех пишет:

 цитата:
та же устойчивость к антибиотикам


Она была всегда.

Мех пишет:

 цитата:
используй дикие звери всякие пенициллины для лечения


Их широко использовали и продолжают использовать грибы. Да и бактерии на это тоже способны.

Есть даже замечательный пример про трёх бактерий:
А - дикая форма;
Б - форма, вырабатывающая яд и резистентная к нему;
В - форма, резистентная к этому яду, но не вырабатывающая его.

Если их попарно помещать в одну пробирку:
А + Б: А быстро гибнет, остаётся только Б;
Б + В: В медленно вытесняет Б, потому что не тратит ресурсы на выработку яда;
А + В: В медленно вытесняет Б, потому что не тратит ресурсы на резистентность к яду.

Если поместить в пробирку все три сразу - А быстро гибнет от яда, дальше по схеме Б+В.

Если засеять на субстрат - получаются колонии, границы которых двигаются, и равновесие, похоже, не достигается никогда.

Если заразить мышей разными формами, и позволить им перекрёстно заражать друг друга - опять-таки ни одна из трёх форм не вымирает.

Мех пишет:

 цитата:
И даже многоклеточными стали


Те, которые стали, называются иначе. Мы мало что знаем об асгард-археях, если бы удалось вырастить их в лаборатории...

Мех пишет:

 цитата:
Ну, собственно говоря, бактерии там и так успешно живут, только поодиночке.


Таки живут, или могут существовать в виде спор?

Спасибо: 1 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 443
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 04.01.19 18:08. Заголовок: Zenitchik пишет: Их..


Zenitchik пишет:

 цитата:
Их широко использовали и продолжают использовать грибы. Да и бактерии на это тоже способны.


Конечно. Но только не для лечения, а скорее для борьбы за жизненное пространство.

 цитата:
Она была всегда.


Не обязательно. Ведь золотистый стафилококк изначально не был устойчив к пенициллину - его таким сделали люди.

 цитата:
Есть даже замечательный пример про трёх бактерий:
А - дикая форма;
Б - форма, вырабатывающая яд и резистентная к нему;
В - форма, резистентная к этому яду, но не вырабатывающая его.

Если их попарно помещать в одну пробирку:
А + Б: А быстро гибнет, остаётся только Б;
Б + В: В медленно вытесняет Б, потому что не тратит ресурсы на выработку яда;
А + В: В медленно вытесняет Б, потому что не тратит ресурсы на резистентность к яду.

Если поместить в пробирку все три сразу - А быстро гибнет от яда, дальше по схеме Б+В.


Супер. Хоть студентам преподавай. Только в предпоследней строчке - лишнее Б, должно быть А (опечатка).

 цитата:
колонии, границы которых двигаются


В смысле под давлением друг друга при соприкосновении? Они будут вести себя так же, как и в пробирке в вашем примере.

 цитата:
Если заразить мышей разными формами, и позволить им перекрёстно заражать друг друга - опять-таки ни одна из трёх форм не вымирает.


Только в этом случае надо учитывать иммунную реакцию хозяев (мышей) на сами бактерии и их яды как два разных антигена.

 цитата:
Те, которые стали, называются иначе.


Истинной многоклеточности ни одна бактерия еще не достигла, более-менее приблизились к ней разве что нитевидные цианобактерии и фото- и хемосинтезирующие бактерии.

 цитата:
Таки живут, или могут существовать в виде спор?


Deinococcus radiodurans живет - он не умеет образовывать споры. А эндоспоры бацилл и клостридий - существуют.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить



Пост N: 3481
Рейтинг: 10
ссылка на сообщение  Отправлено: 05.01.19 13:59. Заголовок: Да, должно быть так ..


Да, должно быть так


 цитата:
А + В: А медленно вытесняет В, потому что не тратит ресурсы на резистентность к яду.



Биолог пишет:

 цитата:
В смысле под давлением друг друга при соприкосновении? Они будут вести себя так же, как и в пробирке в вашем примере.


Да. По субстрату они распространяются медленнее, чем в пробирке, поэтому А умудряется избегать яда.

Кстати, в отдельно взятой мыши бактерии вытесняют друг друга по той же схеме, но в популяции и с перекрёстным заражением, как я уже сказал, ни одна из форм не вымирает.

Биолог пишет:

 цитата:
Истинной многоклеточности ни одна бактерия еще не достигла


Ну я и говорю: мы ничего не знаем об асгард-археях, у нас от них только геномы (они вообще открыты методом метагеномного анализа), но судя по геномам - у них должны быть внутренние мембранные комплексы. Либо они используют соответствующие гены для чего-то другого.

Биолог пишет:

 цитата:
Ведь золотистый стафилококк изначально не был устойчив к пенициллину - его таким сделали люди.



Скорее всего схватил плазмиду от почвенных бактерий.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 444
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 05.01.19 14:30. Заголовок: Zenitchik пишет: у ..


Zenitchik пишет:

 цитата:
у них должны быть внутренние мембранные комплексы


Но такие комплексы есть у многих бактерий, добывающих пропитание фотосинтезом или хемосинтезом. И это не археи. Другое дело, что эти мембраны - производные плазмалеммы, а не отдельные независимые, как у органелл эукариот.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 15517
Откуда: Россия, Москва
Рейтинг: 18
ссылка на сообщение  Отправлено: 05.01.19 19:48. Заголовок: Zenitchik пишет: А +..


Zenitchik пишет:

 цитата:
А + В: А медленно вытесняет В, потому что не тратит ресурсы на резистентность к яду.


Как я понял, это камень-ножницы-бумага, и всё зависит от того, как они будут изначально распределены в пространстве.




Ядовитая (ножницы, ибо самая опасная) вытесняет дикую, потому что убивает её.

Дикая (бумага, ибо чистый лист) вытесняет устойчивую, потому что не тратит силы на резистентность.

Устойчивая (камень, ибо безынициативная, но ей всё нипочём) вытесняет ядовитую, потому что не тратит силы на яд.




Если сначала дикая паслась в сторонке от остальных, устойчивая вытеснит ядовитую, а потом будет вытеснена дикой.

Если в сторонке была ядовитая, то сначала дикая победит устойчивую, а потом вымрет.

Если в сторонке была устойчивая, то встретится она с ядовитой и вытеснит её.




А ежели смешать всех трёх в однородную кучу, первой от яда погибнет дикая, и затем бонус будет у устойчивой. Хотя если яд не настолько суперсильный и его производство тратит много ресурсов - ядовитая вымрет раньше остальных, а потом победит дикая. Забавно, что то же самое получится, если наиболее затратным умением будет резистентность :3

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 447
Рейтинг: 1
ссылка на сообщение  Отправлено: 06.01.19 13:50. Заголовок: Мех пишет: всё зави..


Мех пишет:

 цитата:
всё зависит от того, как они будут изначально распределены в пространстве.


Нет, это почти ни на что не влияет - были бы они вместе (по двое или все втроем) в/на одном субстрате. Причем яд (токсин) сразу диффундирует в субстрат и угнетает "врагов", а борьба за ресурсы требует долгого времени.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 15518
Откуда: Россия, Москва
Рейтинг: 18
ссылка на сообщение  Отправлено: 06.01.19 16:18. Заголовок: Ну, я про то и говор..


Ну, я про то и говорю - это только в лабораторных условиях субстрат однороден и непрерывен.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 448
Рейтинг: 1
ссылка на сообщение  Отправлено: 06.01.19 17:46. Заголовок: Мех пишет: это толь..


Мех пишет:

 цитата:
это только в лабораторных условиях субстрат однороден и непрерывен


Почти, но не совсем: вода везде однородна.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить



Пост N: 3482
Рейтинг: 10
ссылка на сообщение  Отправлено: 06.01.19 21:33. Заголовок: Биолог пишет: вода ..


Биолог пишет:

 цитата:
вода везде однородна.


А почва - не везде. Да и с водой ситуация бывает разная.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 15521
Откуда: Россия, Москва
Рейтинг: 18
ссылка на сообщение  Отправлено: 06.01.19 21:56. Заголовок: А уж если речь о, на..


А уж если речь о, например, нутрях живого существа...

Хмъ, а что насчёт, например, медузы, в которой самое интересное - это её внутренняя микробиота? Вплоть до, скажем, пузырей, заполненных разными бактериями, которые она по химической необходимости сталкивает или разделяет.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 439
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 03.01.19 14:03. Заголовок: Интересная у вас дис..


Интересная у вас дискуссия, господа Мех и Зенитчик!
Мех

 цитата:
То есть он спроектирован так, чтобы вырабатывать лекарства и не терять полезные качества в ходе естественного отбора -


Ах, если бы только отбор был единственным двигателем выработки веществ! Так нет же! На нее влияют состав субстрата, температура и прочее, что не мешает организму расти и процветать, но ограничивает синтез метаболитов. Даже самая продуктивная молочная корова не будет давать молока, если ее не кормить, и даст плохое молоко при плохой кормежке.
Насчет асфальта - что вы скажете о нефти? Есть бактерии, ее кушающие.
Насчет облаков - на каких высотах? Бактерии доходят до 70-80 км над землей (радиобактерии, устойчивые к излучениям), а в более низких слоях - полно всяких. А облака бывают от 0,5 до 80 км от земли.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 15504
Откуда: Россия, Москва
Рейтинг: 18
ссылка на сообщение  Отправлено: 03.01.19 18:10. Заголовок: Биолог пишет: Даже с..


Биолог пишет:

 цитата:
Даже самая продуктивная молочная корова не будет давать молока, если ее не кормить, и даст плохое молоко при плохой кормежке.


Ну, я имею в виду, что эта штука умеет адаптироваться с такой же скоростью, что и бактерии, дабы не отставать от них в гонке вооружений %) Впрочем, это лишь концепт, так сказать, тема для размышлений, а не предложение.


 цитата:
Насчет асфальта - что вы скажете о нефти? Есть бактерии, ее кушающие.


Была такая мысль, но нефти всё меньше и меньше, к тому же залегает она очень глубоко~ Однако была мысль противоположного толка - микроорганизмы, которые её производят из всякой дохлой биомассы ускоренными темпами.


 цитата:
Насчет облаков - на каких высотах?


По желанию =) Лишь бы была возможность туда забраться, например с испаряющейся водой или даже извержениями вулканов, а затем удержаться. Ну или если их туда человеки намеренно закинули, и они всё никак не упадут. У того же, скажем, Конана Дойля в "Ужасе высот" была описана целая небесная экосистема, в основе которой лежат некие почти неосязаемые ленты органического вещества, даже непонятно, живые или чисто стихийные. Нечто вроде них микробы точно могли бы создать, сцепляясь "аксонами", например чтобы эффективнее поглощать ультрафиолет.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 441
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 03.01.19 19:01. Заголовок: Мех У вас интересные..


Мех
У вас интересные мысли!

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 15506
Откуда: Россия, Москва
Рейтинг: 18
ссылка на сообщение  Отправлено: 03.01.19 19:18. Заголовок: Благодарю, стараюсь ..


Благодарю, стараюсь %)

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 440
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 03.01.19 15:16. Заголовок: И вот описания первы..


И вот описания первых из предложенных мною бактерий.

Аспороклостридии и аспоробациллы (Asporoclostridium, Asporobacillus) – потомки клостридий и бацилл эпохи человека (Clostridium, Bacillus). В ту эпоху их отличительной особенностью была способность спорообразования – в виде спор они прекрасно переживали неблагоприятные условия, сохраняя жизнеспособность тысячелетиями. Они были очень похожи морфологически, но занимали разные ниши сообразно своим типам дыхания – анаэробному у клостридий и аэробному у бацилл. Их потомки сохранили свои ниши, но условия существования становились все более благополучными, и они утратили способность спорообразования. Морфологически они неотличимы от своих предков. Живут всесветно в богатых и стабильных условиях плодородных почв и водоемов, не знающих заморозков и засух, где они могут столетиями обходиться без спорообразования. Выполняют функции гнилостных разлагателей, подобно своим предкам (клостридии – анаэробно, бациллы – аэробно). Клостридии при этом сохранили свои способности нитратного и сульфатного дыхания и маслянокислого брожения.

Продолжение следует...

Спасибо: 2 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 442
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 04.01.19 14:39. Заголовок: Продолжаем разговор...


Продолжаем разговор.
Для начала, дадим систематику вышеизложенных аспоробацилл и аспороклостридий:

Тип Фирмикуты (Firmicutes)
Классы Bacilli и Clostridia

Актиномицеты я решил пока не трогать, а заняться воскобактериями. Итак...

Тип Актинобактерии (Actinobacteria)
Класс Актинобактерии (Actinobacteria)
Воскобактерии (Keribacterium) - потомки микобактерий эпохи человека. Их предки, как известно, имели уникальные клеточные стенки - муреина там было не очень много, что компенсировалось слоями миколовых кислот (которые больше нигде в природе не встречались) и восков. Эти слои были настолько стойкими и непроницаемыми, что делали невозможной обычную окраску этих бактерий по Граму. Их потомки пошли по пути полного перехода на миколо-восковые клеточные стенки без муреина. Слои миколовых кислот и восков еще больше усилились и уплотнились, а муреин исчез. В таком положении они стали еще устойчивее, чем были в эпоху человека, и стали заселять более экстремальные ниши - химически агрессивные почвы, где занимаются разложением остатков, труднодоступных другим бактериям.

Спасибо: 2 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 445
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 05.01.19 15:15. Заголовок: Что ж, продолжим... ..


Что ж, продолжим...

Тип Протеобактерии (Proteobacteria)
Класс Альфапротеобактерии (Alphaproteobacteria)
Легуминобактерии (Leguminobacter) - это потомки клубеньковых ризобиев (Rhizobium) эпохи человека. От своих предков они отличаются тем, что живут только в клубеньках на растениях, являющихся потомками бобовых и некоторых других семейств. Это все те же бактероиды, фиксирующие азот с образованием аммиака, который усваивает растение-хозяин, но строго анаэробные. Их особенность в том, что они научились колонизировать сосуды растения и попадать по ним в семязачатки, а оттуда - в зародыш семени, а при вегетативном размножении они просто переходят в новое укореняющееся растение. Так они передаются растениям-потомкам. Этот тесный союз позволил таким растениям заселить малопригодные, бедные азотом почвы. Система азотфиксации у легуминобактерий осталась та же, но они стали образовывать увеличенные клубеньки (размером с грецкий орех и больше) не только на корнях, но и на других частях растения - на стебле и даже листьях. Ткани стебля и листьев при этом не теряют функцию фотосинтеза (наружные слои тканей такого клубенька остаются зелеными). Клубеньки внутри имеют перегородки (компартменты), способствующие равномерному распределению массы бактерий и увеличивающие площадь поглощения аммиака. Мякоть клубенька подкрашена в розовый и даже красный цвет леггемоглобином. Легуминобактерии не могут жить вне клубенька, при его повреждении быстро прекращают азотфиксацию и погибают.

Ну вот, осталось придумать группы растений для этого симбиоза.

Спасибо: 1 
Профиль Цитата Ответить
Из скромности умолчу.




Пост N: 5095
Откуда: Россия, Владимир
Рейтинг: 23
ссылка на сообщение  Отправлено: 07.01.19 14:17. Заголовок: Биолог пишет: Легум..


Биолог пишет:

 цитата:
Легуминобактерии (Leguminobacter) - это потомки клубеньковых ризобиев (Rhizobium) эпохи человека.


Биолог пишет:

 цитата:
Ну вот, осталось придумать группы растений для этого симбиоза.


Суккулентные бобовые в пустыне Атакама или в Средиземноморской котловине? С учётом требований бобовых к опылителям (специализация к насекомоопылению) и распространителям тяжёлых нелетучих и явно зоохорных семян в Атакаме им делать нечего, но где-то в пустынях "ветровой тени" в Северной Америке, или на нашем "полигоне" Средиземноморской котловины они вполне могли бы появиться. Для котловины тогда вырисовывается некое сообщество экстремофильных растений.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить



Пост N: 559
Рейтинг: 3
ссылка на сообщение  Отправлено: 06.01.19 22:41. Заголовок: А можно было бы прид..


А можно было бы придумать бактерии, осуществляющие фиксацию C02. Рубиско - слабое место растений, С4 ради этого сделали специальную органеллу. Что, если у другой группы такую роль выполняет какая-нибудь бактерия, причём С5->С6 она делает каким-то своим способом?

Точно так же, при малой концентрации углекислого газа в воздухе будет выгодно извлекать его из меловых пород, а не из воздуха.

Ещё вариант: бактерия, научившаяся расщеплять некую пластмассу, начинает использовать ферменты для обратной реакции (как правило, всякий фермент катализирует реакцию в обе стороны) - синтеза себе оболочки из полиэтилена или капрона. Кроме "своих", эту оболочку никто не развалит, особенно эукариоты.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 449
Рейтинг: 1
ссылка на сообщение  Отправлено: 07.01.19 16:23. Заголовок: Zenitchik А почва - ..


Zenitchik

 цитата:
А почва - не везде. Да и с водой ситуация бывает разная.


В почве бактерии живут в микрокаплях воды в полостях между кристаллами минералов (или просто камешками) и частицами гумуса, а также образуют микроколонии на поверхности этих кристалликов. А вода не мешает никому плавать - две бактерии всегда могут "сплыться" вместе. Как я понял, Мех имел в виду именно возможность встречи в одном субстрате.

Мех

 цитата:
Хмъ, а что насчёт, например, медузы, в которой самое интересное - это её внутренняя микробиота? Вплоть до, скажем, пузырей, заполненных разными бактериями, которые она по химической необходимости сталкивает или разделяет.


А смысл? Медузы в наше время прекрасно без этого живут! Но мысль интересная!

Автор

 цитата:
Суккулентные бобовые в пустыне Атакама или в Средиземноморской котловине? С учётом требований бобовых к опылителям


А почему только бобовые? Клубеньки с ризобиями уже сейчас известны у некоторых не-бобовых растений. Поэтому я так и закончил тот свой пост - приглашением придумать.

Inry

 цитата:
А можно было бы придумать бактерии, осуществляющие фиксацию C02


Это уже умеют многие сегодняшние автотрофные бактерии - фотоавтотрофы (цианобактерии, зеленые и пурпурные бактерии, археи-галофилы и т.д.) или хемоавтотрофы (серобактерии, железобактерии и др.). Все уже есть.

 цитата:
Точно так же, при малой концентрации углекислого газа в воздухе будет выгодно извлекать его из меловых пород, а не из воздуха.


Вышеуказанные автотрофы живут в воде, а не в воздухе. Растения же тоже не в воздухе плавают - им нужны минералы и вода, кроме СО2.

 цитата:
(как правило, всякий фермент катализирует реакцию в обе стороны)


Это не так, вы ошибаетесь.

 цитата:
синтеза себе оболочки из полиэтилена или капрона


То есть неоцен будет завален их мономерами? Или бактерии должны сперва синтезировать мономеры, а потом полимеризовать? И все ради оболочек? Муреин и сейчас их неплохо защищает, не говоря уж об оболочках архей.
Вы сильно "плаваете" в микробиологии и биохимии, Inry.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить



Пост N: 562
Рейтинг: 3
ссылка на сообщение  Отправлено: 07.01.19 18:30. Заголовок: > Вы сильно "..


> Вы сильно "плаваете" в микробиологии и биохимии, Inry.
Дуэль, что ли устроить на любом тесте по биологии с контролем времени? Пожалуйста, не придирайтесь к словам участников - не всегда есть возможность сформулировать идею в формате, пригодном для академической публикации.

Вы, похоже, про проблему рубиско знаетен? (что он работает медленно и промахивается при низкой концентрации CO2. И что это может стать основной проблемой растений при фиксации всей углекислоты в коре). Поэтому любой лучший путь сразу даст растению +200 к выживаемости. Да, есть водоросли с улучшенным рубиско. Но высшие растения как-то не сильно склонны к горизонтальному обмену генами, тем более пластид. Так что может появиться и другой способ (если уж появились С4).

>Это не так, вы ошибаетесь.
Конечно, не все, но можно до кучи указать ферментов с обратимостью. Начиная с классической АТФ-синтетазы. В Цикле Кребса таких половина.

В неоцене продуктов деятельности человека (в массовом количестве) не останется. Но для бактерий пройдёт достаточно большая эпоха, чтобы приспособиться к их использованию.

>Муреин и сейчас их неплохо защищает, не говоря уж об оболочках архей.
А давайте вообще "всем животным и сейчас неплохо живётся, зачем всякие неоцены разрабатывать: всё останется как и было."?
Если появляется новое вещество, на него появляются бактерии.
Если бактерия получает набор ферментов для работы с прежде несуществовавшими веществами, как-то она их сможет и потом использовать.
В частности, для сражения с эукариотами, у которых скорость эволюции намного ниже.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 452
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 07.01.19 20:46. Заголовок: Inry пишет: Дуэль, ..


Inry пишет:

 цитата:
Дуэль, что ли устроить на любом тесте по биологии с контролем времени?


Дуэль с человеком, который хочет придумать бактерии, существующие уже миллиарды лет, потому что забыл об их существовании?

 цитата:
Пожалуйста, не придирайтесь к словам участников - не всегда есть возможность сформулировать идею в формате, пригодном для академической публикации.


Образования не хватает? Сторонники научного атеизма должны знать научную терминологию как "отче наш".

 цитата:
Вы, похоже, про проблему рубиско знаетен? (что он работает медленно и промахивается при низкой концентрации CO2. И что это может стать основной проблемой растений при фиксации всей углекислоты в коре).


Во-первых, посчитайте, сколько миллионов лет уже живут растения с "плохим" ферментом и вымирать не собираются. Во-вторых, это тема о микроорганизмах, а не растениях, не путайте.

 цитата:
АТФ-синтетазы


Это же комплекс из субъединиц, каждая из которых имеет свою функцию. Ну и в цикле Кребса - то же самое.

 цитата:
В неоцене продуктов деятельности человека (в массовом количестве) не останется. Но для бактерий пройдёт достаточно большая эпоха, чтобы приспособиться к их использованию.


Взаимоисключающие пункты: веществ почти нет, но бактерии их используют. Если ксенобиотики будут исчезать, то и организмы будут прекращать их кушать.

 цитата:
Если бактерия получает набор ферментов для работы с прежде несуществовавшими веществами, как-то она их сможет и потом использовать.
В частности, для сражения с эукариотами, у которых скорость эволюции намного ниже.


Как же сейчас бактерии живут без "сражений" с эукариотами? И конечно, "ферменты для работы с веществами" в "сражении против эукариот" полезны только тогда, когда в клетках эукариот есть эти вещества.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 15528
Откуда: Россия, Москва
Рейтинг: 18
ссылка на сообщение  Отправлено: 07.01.19 18:51. Заголовок: Биолог пишет: А смыс..


Биолог пишет:

 цитата:
А смысл? Медузы в наше время прекрасно без этого живут!


Ну я потому и сказал "например" - это может быть кто угодно ещё, просто кишечнополостные кажутся наиболее подходящими кандидатами благодаря особенностям анатомии %)

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 468
Рейтинг: -1
ссылка на сообщение  Отправлено: 16.04.19 12:56. Заголовок: Возвращаемся к работ..


Возвращаемся к работе над потенциальной главой "Неоцен под микроскопом".
Набросал текст для общей части главы, что перед описаниями видов:

В эпоху человека на бактериях держалась большая часть циркуляции всех веществ в природе. Бактерии населяли воздух, пресную и соленую воду, почвы всех типов и организмы животных и человека.
Бактерии почвы в то время разлагали органические остатки до минеральных веществ (минерализация, аммонификация), освобождая при этом углерод и азот. Они фиксировали азот из атмосферы и переводили его в аммиак (азотфиксация), а их соседи переводили аммиак в нитриты и затем в нитраты (нитрификация). На этих этапах азот становился доступен растениям. Другие соседи, наоборот, возвращали азот из нитратов и нитритов в аммиак и молекулярный азот (денитрификация).
Бактерии воды занимались тем же, только в меньших масштабах. При этом в воде жили фотосинтезирующие бактерии (цианобактерии, пурпурные и зеленые бактерии) и археи (галобактерии).
В организмах животных и человека (в кишечнике, на коже, в половых органах, полости рта и верхних дыхательных путях) бактерии образовывали нормальную микробиоту, а некоторые вызывали заболевания. При этом микробиом кишечника на 60-70% формировался молочнокислыми бактериями, игравшими важнейшую защитную роль, а микробиом кожи – грамположительными кокками (Streptococcus, Staphylococcus). Микробиом кишечника защищал хозяниа от многих патогенных «чужаков», помогал усваивать пищу и синтезировал некоторые витамины.
В неоцене моря остались морями, почвы – почвами, а животные – животными. Поэтому радикальных изменений в бактериальных и архейных микробиомах также не случилось, кроме связанных с исчезновением человека. Лишь некоторые бактерии изменили свое строение или функции.
С исчезновением человека вымерли его паразиты, для которых он служил единственным резервуаром. Так, не стало трахомной хламидии (Chlamydia trachomatis), гонококка (Neisseria gonorrhoeae, возбудитель гонореи) и бледной трепонемы (Treponema pallidum, возбудитель сифилиса).

Предложения и дополнения принимаются!

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 1214
Рейтинг: -1
ссылка на сообщение  Отправлено: 04.09.19 11:07. Заголовок: Работа с иллюстрация..


Работа с иллюстрациями инфекциомухи (уже сделана мной) и самбио сотоварищи (скоро будет) из Бестиария заставила меня внимательно изучить описания. А это, в свою очередь, навело на мысль об описани бактерий, живущих в теле этих мух и служащих им биологическим оружием.
Итак, два вида:

Аспороклостридий инфекциомухи (Asporoclostridium dolichomusci)
Тип Фирмикуты (Firmicutes)
Семейство Клостридиевые (Clostridiaceae)

Стафилококк самбио (Staphylococcus sambii)
Тип Фирмикуты (Firmicutes)
Семейство Стафилококковые (Staphylococcaceae)

Мушиная палочка (Escherichia musci)
Тип Протеобактерии (Proteobacteria)
Семейство Энтеробактерии (Enterobacteriaceae)


Все три вида живут в карманах пищеварительного тракта самбио и инфекциомухи и вызывают тяжелые септические токсикоинфекции у животных.
Подробные описания дам позднее.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 1218
Рейтинг: -1
ссылка на сообщение  Отправлено: 05.09.19 14:32. Заголовок: Аспороклостридий инф..


Аспороклостридий инфекциомухи (Asporoclostridium dolichomusci)
Тип Фирмикуты (Firmicutes)
Семейство Клостридиевые (Clostridiaceae)

В эпоху человека клостридии были очень распространенной группой анаэробных почвенных бактерий, хотя некоторые виды обитали (постоянно или временно) в кишечнике животных и человека. Некоторые виды были смертельно опасными для человека благодаря очень мощным экзотоксинам – например, возбудители ботулизма (C. botulinum), столбняка (C. tetani) и газовой гангрены (C. perfringens и близкие виды).
В неоцене некоторые клостридии утратили спорообразование благодаря благоприятным условиям, в которых оказались при вступлении в симбиоз с насекомыми.
Аспороклостридий инфекциомухи – потомок C. perfringens. Это крупная (3-4 мкм длиной и 2 мкм толщиной) грамположительная облигатно анаэробная палочка, живущая в карманах пищеварительного тракта некоторых мух (в частности, инфекциомух и самбио). Там она (хемоорганотроф) питается пищей мухи, не причиняя ей вреда. Но при попадании в тело живого животного картина резко меняется. Бактерия выделяет мощный экзотоксин (нейротоксин), по действию подобный ботулотоксину палочки ботулизма и тетаноспазмину столбнячной палочки, а также гемолитические ферменты. Такой набор быстро (без "помощи" других бактерий - в течение двух-трех дней) убивает животное, ведь муха вводит это «биологическое оружие» прямо в ткани и кровоток жертвы, обусловливая моментальный сепсис.
Когда муха прилетает «обедать», она всасывает с пищей новую порцию бактерий, размножившихся в теле жертвы. Фактически, бактерии-симбионты мух циркулируют между мухой и ее жертвами, почти не попадая в окружающую среду, что и позволило им обходиться без эндоспор. Помимо клостридий, в состав этого смертельного микробиома мухи входят мушиная палочка – потомок кишечной палочки, обитавшей изначально в кишечнике животных (в том числе насекомых), и стафилококк самбио – потомок золотистого стафилококка, входившего в нормальную микробиоту человека и животных.

Спасибо: 1 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 1223
Рейтинг: -1
ссылка на сообщение  Отправлено: 06.09.19 12:58. Заголовок: Стафилококк самбио (..


Стафилококк самбио (Staphylococcus sambii)
Тип Фирмикуты (Firmicutes)
Семейство Стафилококковые (Staphylococcaceae)

Стафилококки – грамположительные кокки в гроздях – были широко распространенными обитателями организма животных и человека в голоцене. Но среди них были и очень опасные, например, золотистый стафилококк Staphylococcus aureus. Один из потомков этого вида вступил в симбиоз с насекомыми.
Стафилококк самбио обитает в карманах пищеварительного тракта мух самбио и инфекциомух, питаясь пищей мухи. При укусе жертвы мухой он попадает в ткани и кровоток животного и быстро размножается, а заодно выделяет свое главное «оружие» – плазмокоагулазу. Этот фермент у него достиг очень высокой активности и очень быстро вызывает свертывание крови животного-жертвы прямо в сосудах – смертельный процесс. Когда муха начинает питаться с трупа, бактерии всасываются через хоботок и «биологическое оружие» мухи «перезаряжается».
Морфологически этот вид не отличается от своих предков: он имеет вид грамположительных кокков, образующих грозди. Факультативный анаэроб, устойчив к высокому содержанию соли. Хемоорганотроф, мезофил, устойчив к иммунным реакциям животных. Помимо плазмокоагулазы, выделяет сильные лейкоцидины (токсины, убивающие лейкоциты) для защиты от иммунных сил жертвы, заодно помогая своим соседям – мушиной палочке и клостридиям.

Спасибо: 1 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 1231
Рейтинг: -1
ссылка на сообщение  Отправлено: 07.09.19 20:54. Заголовок: Мушиная палочка (Esc..


Мушиная палочка (Escherichia musci)
Тип Протеобактерии (Proteobacteria)
Семейство Энтеробактерии (Enterobacteriaceae)

Энтеробактерии были одной из самых многочисленных и распространенных групп бактерий в голоцене. Их представители населяли все среды – воду, почву и организмы животных (включая беспозвоночных) и человека. Кишечные палочки (Escherichia) были самым распространенным родом кишечных бактерий, частью важнейшими кишечными симбионтами, а частью – опасными возбудителями инфекций (токсигенные штаммы). Их потомки в неоцене в основном мало изменились, но некоторые перешли к новому образу жизни.
Мушиная палочка – это все та же грамотрицательная факультативно-анаэробная палочка, подвижный перитрих, хемоорганотроф. Но живет она в карманах пищеварительного тракта мух-ктырей (инфекциомух и самбио). Попадая в тело животного при укусе мухой, она быстро размножается и выделяет целый набор сильных токсинов, среди которых основная роль принадлежит гемолизинам. Выделяясь в больших концентрациях, они вызывают молниеносный распад эритроцитов и гемоглобина в крови животного, что смертельно. А ведь параллельно действуют нейротоксины клостридиев и плазмокоагулаза стафилококка. Этот вид почти не образует эндотоксинов, клетки просто не успевают разрушаться для их высвобождения – слишком быстро умирает пораженное животное.
Мушиная палочка, как и клостридии и стафилококки, быстро размножается в теле обреченного животного, и муха получает возможность «перезарядить» свое «биологическое оружие».

Спасибо: 1 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 1619
Рейтинг: 4
ссылка на сообщение  Отправлено: 08.09.19 22:35. Заголовок: Биолог , спасибо за ..


Биолог , спасибо за новых микрокозявок, добавил их всех в каталог Ваших видов.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 1234
Рейтинг: -1
ссылка на сообщение  Отправлено: 09.09.19 10:12. Заголовок: wovoka Спасибо! Рад..


wovoka
Спасибо! Скрытый текст


Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 1418
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 21.10.19 15:06. Заголовок: Думаю описать еще во..


Думаю описать еще вот такую цианобактерию для пресных водоемов неоцена:

Носток вольвоксовидный (Nostoc volvoxoides)
Тип Цианобактерии (Cyanobacteria)
Семейство Ностоковые (Nostocaceae)


Шаровидные колонии с дочерними внутри, как у вольвокса. Подробнее - чуть позже.

Спасибо: 1 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 1419
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 21.10.19 18:29. Заголовок: Итак, вот оно: Ност..


Итак, вот оно:

Носток вольвоксовидный (Nostoc volvoxoides)
Тип Цианобактерии (Cyanobacteria)
Семейство Ностоковые (Nostocaceae)

Местообитание: стоячие пресные воды умеренного пояса.
Цианобактерии в эпоху человека были самой крупной и значимой группой фотосинтезирующих автотрофных прокариот, населявшей пресные и соленые водоемы и почву. Некоторые виды вступали в симбиоз с грибами в составе лишайников и даже с цветковыми растениями, причем в последнем случае растение получает необходимый азот, т. к. цианобактерии способны к фиксации атмосферного азота.
Представители рода носток (Nostoc) были широко распространены в пресных водоемах и сырых почвах, где образовывали шаровидные желеобразные колонии. Их потомки в неоцене перешли к иному образу жизни.
Вольвоксовидный носток сохранил клеточную морфологию своих предков. Его клетки с системой мембран (тилакоиды), несущей пигменты для фотосинтеза, образуют не цепочки, а плотные однослойные коврики, замкнутые в полый шарик размером с горошину, покрытый желеобразной капсулой. Среди клеток шарика выделяются крупные гетероцисты, унаследованные от предков, – специализированные клетки, фиксирующие азот из атмосферы. Также имеются крупные клетки с пузырьками газа в цитоплазме, что позволяет шарику парить в приповерхностных слоях воды (и даже всплывать и немного выступать из воды) и получать максимум света и азота.
Обычная окраска шариков – типично сине-зеленая, на ее фоне выделяются светлые желтоватые сферические гетероцисты и почти бесцветные «газовые» клетки, и те и другие в 1,5-2 раза крупнее обычных клеток.
Клетки вольвоксовидного ностока размножаются делением, причем дочерние клетки откладываются внутрь шарика, а материнские постепенно отмирают. Внутри шарика таким образом формируется по 2-3 дочерних колонии, которые выходят наружу в результате разрыва материнской колонии.
В благоприятных условиях вольвоксовидный носток размножается в больших количествах и вызывает сине-зеленое цветение воды. Шарики при этом могут слипаться в лежащие на поверхности воды ковры (маты), которые достигают 1-2 метра в поперечнике и настолько плотны, что по ним свободно ходят многие насекомые и другие мелкие животные.

Спасибо: 1 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 1664
Рейтинг: 5
ссылка на сообщение  Отправлено: 21.10.19 19:23. Заголовок: Биолог, очень интере..


Биолог, очень интересно.

Я только не пойму, где конкретно они живут?
Вы не могли бы в следующих описаниях четко указывать ареал обитания в шапке описания?

Вот так:
Тип
Семейство
Ареал


Мне это нужно, чтобы я мог добавить Ваше новое существо в каталог Ваших видов.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 1421
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 22.10.19 10:32. Заголовок: wovoka пишет: Я тол..


wovoka пишет:

 цитата:
Я только не пойму, где конкретно они живут?


Добавил указание местообитания.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 1677
Рейтинг: 4
ссылка на сообщение  Отправлено: 22.10.19 19:55. Заголовок: Биолог пишет: Добав..


Биолог пишет:

 цитата:
Добавил указание местообитания.


Добавил в Ваш список.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 1425
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 22.10.19 20:01. Заголовок: wovoka Спасибо!..


wovoka
Спасибо!

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить



Пост N: 2
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 23.10.19 10:32. Заголовок: Просеулось стадо!..


Просеулось стадо!

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить



Пост N: 3
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 23.10.19 10:36. Заголовок: Что относительно пом..


Что относительно помощников растений.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 1429
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 23.10.19 12:26. Заголовок: Липарис Думаю, можн..


Липарис
Думаю, можно сделать, но надо почитать, что за виды там и как они с растением взаимодействуют. Ведь может же быть конкуренция с другими азотфиксаторами, например, ризобиями (Rhizobium).

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 1681
Рейтинг: 4
ссылка на сообщение  Отправлено: 23.10.19 21:58. Заголовок: Биолог пишет: Ведь ..


Биолог пишет:

 цитата:
Ведь может же быть конкуренция с другими азотфиксаторами, например, ризобиями (Rhizobium).


Так конкуренция - это ж самое интересное

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 1439
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 24.10.19 10:44. Заголовок: wovoka пишет: Так к..


wovoka пишет:

 цитата:
Так конкуренция - это ж самое интересное


Только растение, в организме которого бактерии воюют, будет явно не в восторге.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 1458
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 26.10.19 19:35. Заголовок: Так-с, надо (хочется..


Так-с, надо (хочется ) придумать что-нибудь поинтересней с археями. Их такое разнообразие, что даже не знаю, за что взяться. Варианты:
1) метаногены - кишечные симбионты животных;
2) галоархеи - галофилы в гиперсоленых водоемах, наилучший кандидат - Средиземноморская котловина;
3) экстремофилы в горячих источниках и кислотных водах.
Во всех случаях надо как-то обыграть новшества в биохимии, а это непросто...

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 17037
Откуда: Россия, Москва
Рейтинг: 21
ссылка на сообщение  Отправлено: 26.10.19 20:51. Заголовок: Биолог пишет: экстре..


Биолог пишет:

 цитата:
экстремофилы в горячих источниках и кислотных водах.


Пищеварилка сойдёт?

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 1699
Рейтинг: 4
ссылка на сообщение  Отправлено: 26.10.19 21:05. Заголовок: Биолог, хорошие идеи..


Биолог, хорошие идеи.
Вторая и третья задумки особенно интересны.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 1460
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 27.10.19 13:23. Заголовок: Мех пишет: Пищевари..


Мех пишет:

 цитата:
Пищеварилка сойдёт?


Вы про желудочный сок? Нет, потому что животным в желудке не нужны процессы, вызываемые археями.

wovoka
Спасибки, подумаем над чем-нибудь из этого.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 17038
Откуда: Россия, Москва
Рейтинг: 21
ссылка на сообщение  Отправлено: 27.10.19 17:23. Заголовок: Биолог пишет: Нет, п..


Биолог пишет:

 цитата:
Нет, потому что животным в желудке не нужны процессы, вызываемые археями.


Им также не нужны процессы, вызываемые кишечной и ботулизмовой палочками, что ничуть не мешает нормальному существованию последних %)

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 1462
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 27.10.19 18:14. Заголовок: Мех пишет: Им также..


Мех пишет:

 цитата:
Им также не нужны процессы, вызываемые кишечной и ботулизмовой палочками, что ничуть не мешает нормальному существованию последних %)


Кишечная палочка (Escherichia coli) - очень важный симбионт, помогающий переваривать пищу и частично синтезирующий некоторые витамины. Она - постоянный член нормальной микробиоты кишечника человека и животных. Недаром же она используется в пробиотиках. А палочка ботулизма (а не "ботулизмовая") - обычный комменсал.
Существованию-то не мешает, но это будут фоновые виды, ничего интересного. Автор же говорил о поиске новых интересных взаимосвязей.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 1474
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 28.10.19 20:11. Заголовок: С археями мало что к..


С археями мало что клеится. Пока есть идея только одного вида, пока фонового, но с потенциалом к взаимосвязям с кем-то еще:

Палочка соляной крови (Halobacterium sanguinisalis)
Тип Эвриархеоты (Euryarchaeota)
Класс Галобактерии (Halobacteria)

Местообитание: гиперсоленые болота Средиземноморской котловины, в воде и на солевых отложениях
В эпоху человека археи (Archaea) населяли разнообразные ниши с экстремальными условиями, главным образом очень высокой температурой, очень высокой кислотностью или концентрациями соли на уровне насыщенной рапы. Такими способностями они обладали благодаря отличиям биохимии от бактерий и эукариот: клеточные стенки у большинства были без муреина и состояли из высокоустойчивых белков, а мембранные липиды имели уникальную структуру, также отличающуюся стойкостью. Их потомки в неоцене сохранили большинство предковых особенностей, но у них появились новые ниши.
Палочка соляной крови обитает в мире соли в Средиземноморской котловине. От своих предков - голоценовых галобактерий - она унаследовала фотосинтез при помощи бактериородопсина, который придавал клеткам предков красный цвет. При этом углерод не ассимилируется, а добывается из других источников. Как и ее предки, она накапливает соли натрия и калия внутри клетки (кристаллы в цитоплазме), чтобы противостоять осмотическому оттоку воды из клетки во внешнюю среду. Но обитание под палящим солнцем привело к новой адаптации: накоплению дополнительных пигментов, защищающих клетку от избытка солнечного ультрафиолета. Эти пигменты придают ромбовидным клеткам этого вида темную красно-фиолетовую окраску, напоминающую венозную кровь человека (отсюда название). Ромбовидные клетки 8-10 мкм в поперечнике плоские и очень тонкие и прилегают гранями друг к другу наподобие аргайла и склеиваются, образуя пластинки из 10-20 штук (размером до 100 мкм). Краевые клетки при этом несут археллумы - видоизмененные архейные жгутики, - благодаря чему вся пластинка может самостоятельно плавать.
Размножаясь в больших количествах, эти организмы вызывают темно-красное с фиолетовым оттенком окрашивание рапы, а также соляных пластов и кристаллов в тех местах, где на них есть достаточное для микроорганизмов количество влаги.
Палочка соляной крови участвует в круговороте фосфора, трансформируя его соединения, а также вступает в симбиоз с нитчатой водорослью Filodunaliella mediterranea, от которой получает углерод в виде глицерина. Нити дюналиеллы при этом часто зацепляются за пластинки галобактерии и плавают вместе с ними.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 1478
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 29.10.19 11:44. Заголовок: Описание галобактери..


Описание галобактерии дополнено и подредактировано.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 1723
Рейтинг: 4
ссылка на сообщение  Отправлено: 29.10.19 12:25. Заголовок: Биолог пишет: Описа..


Биолог пишет:

 цитата:
Описание галобактерии дополнено и подредактировано.


И добавлено в список Ваших видов.

Интересное существо.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 1479
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 29.10.19 12:37. Заголовок: wovoka Спасибо! Ско..


wovoka
Спасибо! Скоро будет описание той самой водоросли дюналиеллы.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 1727
Рейтинг: 4
ссылка на сообщение  Отправлено: 29.10.19 13:07. Заголовок: Биолог пишет: Скоро..


Биолог пишет:

 цитата:
Скоро будет описание той самой водоросли дюналиеллы.


Ждём.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 1482
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 29.10.19 20:26. Заголовок: wovoka пишет: Ждём...


wovoka пишет:

 цитата:
Ждём.


Дождались :

Филодюналиелла средиземноморская (Filodunaliella mediterranea)
Отдел Зеленые водоросли (Chlorophyta)
Порядок Хламидомонадные (Chlamydomonadales)

Местообитание: гиперсоленые воды Средиземноморской котловины
В эпоху человека очень немногие водоросли могли жить в гиперсоленой воде. Самым известным родом таких организмов были дюналиеллы (Dunaliella) – одноклеточные подвижные зеленые водоросли, очень похожие на хламидомонад и часто вызывавшие цветение воды. В неоцене их потомки в некоторых новых экологических нишах претерпели заметные изменения.
Филодюналиеллы из одноклеточных стали нитчатыми – они образуют короткие цепочки из 4-5 овальных клеток, заключенных в общую слизисто-маслянистую капсулу. Клетки около 10 мкм в диаметре, нити длиной около 50 мкм, и одна из двух концевых клеток несет полярный пучок жгутиков, вращение которых тянет цепочку клеток вперед.
Каждая клетка, подобно предковым формам, содержит крупный хлоропласт со сферическим пиреноидом и крахмальными зернами, а также большое количество глицерина, который защищает клетку от осмотического влияния рапы. У предков хлорофилл в хлоропласте обычно маскировался большим количеством каротиноидов для защиты от ультрафиолета, придавая клетке красно-оранжевую окраску. У филодюналиеллы их количество снижено – в своем обиталище она прикрыта пластинками палочки соляной крови (Halobacterium sanguinisalis) и часто с ними сцепляется, поэтому ее клетки имеют золотисто-желтый цвет.
Размножается филодюналиелла так же, как и ее предки: митотическим делением, но в неблагоприятных условиях (высыхание, опреснение) клетки внутри цепочки попарно образуют зигоспоры, а оставшиеся без пары гибнут. Зигоспоры имеют толстую стойкую оболочку, позволяющую долго ждать новых подходящих условий, и легко переносятся ветром и животными, чтобы в новых условиях прорасти множеством новых клеток, которые делятся с образованием цепочек.
Выделение филодюналиеллой больших количеств глицерина дает возможность существования галобактериям (источник углерода). При бурном размножении с галобактериями образуется темное кроваво-красное окрашивание, а без галобактерий – золотисто-желтое, в обоих случаях может наблюдаться маслянистость воды из-за глицерина.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 1730
Рейтинг: 4
ссылка на сообщение  Отправлено: 29.10.19 20:38. Заголовок: Интересно :sm36: ..


Интересно

Биолог пишет:

 цитата:
поэтому ее клетки имеют золотисто-желтый цвет.


Может нарисуете? Красиво же.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 1485
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 30.10.19 11:31. Заголовок: wovoka пишет: Может..


wovoka пишет:

 цитата:
Может нарисуете? Красиво же.


Может быть. Но чуть позже.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 13070
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 30.10.19 20:39. Заголовок: А у меня вопрос - ги..


А у меня вопрос - гигантскую одноклеточную водоросль в средиземноморские озера селить будете?

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 1490
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 31.10.19 11:38. Заголовок: Мамонт Надо же кто ..


Мамонт
Нет, не буду.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 1512
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 02.11.19 21:00. Заголовок: Так-с, пришла пора п..


Так-с, пришла пора подумать о дрожжах, выращиваемых муравьями масеуалли, которых описал wovoka.
Сделаем так:

Муравьиные дрожжи (Myrmecomyces macehuallii)
Отдел Аскомицеты (Ascomycota)
Класс Сахаромицеты (Saccharomycetes)

Местообитание: исключительно в колониях почтека при уходе со стороны масеуалли.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 1757
Рейтинг: 4
ссылка на сообщение  Отправлено: 02.11.19 22:19. Заголовок: Биолог пишет: пора ..


Биолог пишет:

 цитата:
пора подумать о дрожжах, выращиваемых муравьями масеуалли


Там точно указана предковая форма Tyridiomyces formicarum
И перенесу сюда важную информацию из описания дрожжей: Дрожжи Tyridiomyces formicarum для своего развития нуждаются в растительном компосте, смешанном с субстратом из измельченных насекомых, а также в удобрениях из фекалий гусениц-лепидоптер.
А в остальном с нетерпением жду Вашего описания.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 1513
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 03.11.19 16:00. Заголовок: wovoka Спасибо, я у..


wovoka
Спасибо, я уже проверял, что это за предок. Сахаромицет и есть. Описанный субстрат - это смесь сахаров (компост и помет гусениц) и белков (измельченные насекомые), все закономерно. В неоцене вполне может быть примерно также. А вот название сделаем покрасивше:

"Муравьиный янтарь", масеуалломицет (Macehuallomyces myrmecophilus)
Отдел Аскомицеты (Ascomycota)
Класс Сахаромицеты (Saccharomycetes)

Местообитание: исключительно в колониях почтека при уходе со стороны масеуалли
В эпоху человека дрожжи - одноклеточные грибы - были в основном сапрофитами и комменсалами, хотя некоторые вызывали опасные болезни (Candida, Cryptococcus). Дрожжи были разнородной сборной группой грибов из трех отделов (аскомицетов, базидиомицетов и дейтеромицетов) и в природе обитали в почве, воде и на растениях. Но некоторые формы перешли к жизни в гнездах муравьев на подготавливаемых муравьями субстратах, и при этом служили муравьям пищей. Так, вид Tyridiomyces formicarum из числа сахаромицетовых аскомицетов жил в гнездах муравья Cyphomyrmex rimosus, и в неоцене потомки этого муравья продолжают культивировать потомков этого вида дрожжей.
"Муравьиный янтарь" по-прежнему имеет характерную для дрожжей-сахаромицетов морфологию: овальные или яйцевидные клетки в среднем 7-8 × 25-30 мкм, размножающиеся почкованием. Почек на одной клетке образуется много - до десятка, и часто в одной плоскости. При этом почки не отделяются сразу от материнской клетки и могут давать вторичные почки, а те - третичные и т. д. Это приводит к образованию веерообразных или дискообразных древовидно ветвящихся агрегатов клеток. Часто такие агрегаты растут в высоту. Такой рост приводит к покрытию субстрата творожистым слегка просвечивающим налетом чистой культуры гриба толщиной около 0,5 см.
Благодаря хорошему уходу со стороны муравьев (подготовка субстратов и очистка от загрязнений) масеуалломицет процветает и синтезирует много веществ, необходимых для питания муравьев. В числе этих веществ много каротиноидов, поэтому клетки и образуемый ими налет имеют янтарно-оранжевый цвет - отсюда название вида. А синтез полисахаридов и белков создает творожистость и даже хрящеватость культуры.
В условиях, созданных муравьями, "муравьиный янтарь" не нуждается в спорообразовании, но при разрушении гнезда животными-мирмекофагами все же может их лишиться. В этом случае агрегаты клеток распадаются. Клетки покрываются плотной толстой оболочкой и делятся редукционным делением внутри оболочки с образованием 4 аскоспор, а общая оболочка материнской клетки играет роль аска (сумки). В таком виде аск со спорами может жить достаточно долго, чтобы дождаться восстановления гнезда муравьями и снова получить необходимый уход. Тогда он прорастет и даст начало новому поколению, клетки которого вступают в конъюгацию, чтобы восстановить диплоидность, и снова почкуются.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 1763
Рейтинг: 4
ссылка на сообщение  Отправлено: 03.11.19 16:19. Заголовок: Замечательное описан..


Замечательное описание!!!
Спасибо огромное!!!
Сейчас добавлю в список Ваших видов!!!

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 1574
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 10.11.19 14:00. Заголовок: Что-то не клеится у ..


Что-то не клеится у меня ничего с насекомыми, ничего путного не приходит в голову.
Но зато идеи новых микроорганизмов рождаются быстро. Вот прикидки:
1. Потомок Bacillus thuringiensis - знаменитой инсектицидной палочки, взятой на вооружение человеком. Надо ему придумать новые свойства (точнее, ее знаменитому токсину) и новых хозяев.
2. Потомок голоценовой энтомофторы - белопузырчатая головня насекомых. Название - от сходства с пузырчатой головнёй злаков (вызываемой устилаговыми грибами).
3. Ржавчина насекомых - тоже потомок энтомофторы, но название от сходства с ржавчиной злаков (вызываемой пукциниевыми грибами).
4. Светящийся кордицепс - потомок кордицепсов, научившийся светиться для привлечения ночных насекомых.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 1922
Рейтинг: 4
ссылка на сообщение  Отправлено: 10.11.19 15:14. Заголовок: Задумки интересные. ..


Задумки интересные. Эти твари будут вызывать болезни у муравьёв?

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 17096
Откуда: Россия, Москва
Рейтинг: 21
ссылка на сообщение  Отправлено: 10.11.19 17:22. Заголовок: Биолог пишет: Ржавчи..


Биолог пишет:

 цитата:
Ржавчина насекомых


ГГГшненько %)


 цитата:
Светящийся кордицепс - потомок кордицепсов, научившийся светиться для привлечения ночных насекомых.


Насколько мне известно, свет их не приманивает, а сбивает навигацию по звёздному свету, меняя траекторию с прямой на спиральную.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 1576
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 10.11.19 19:21. Заголовок: wovoka Задумки инте..


wovoka

 цитата:
Задумки интересные. Эти твари будут вызывать болезни у муравьёв?


Да, конечно! Кордицепс же.

Мех

 цитата:
ГГГшненько %)


Ага! Но ведь и ржавчина пшеницы - тоже прикольно звучит, но является официальным названием болезни этого злака - по сходству цвета бесполого спороношения гриба (в виде пятен на листьях и стеблях) с окислами железа.

 цитата:
Насколько мне известно, свет их не приманивает, а сбивает навигацию по звёздному свету, меняя траекторию с прямой на спиральную.


Есть несколько гипотез. Но вы говорите о механизме, результат которого ясен - прилет к источнику света.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 1925
Рейтинг: 4
ссылка на сообщение  Отправлено: 10.11.19 19:29. Заголовок: Биолог пишет: Да, к..


Биолог пишет:

 цитата:
Да, конечно! Кордицепс же.


А у почтека или конкистадоров, или у обоих?

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 1579
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 10.11.19 19:42. Заголовок: wovoka пишет: А у п..


wovoka пишет:

 цитата:
А у почтека или конкистадоров, или у обоих?


Энтомофтора - у всех подряд, она не очень специфична (хотя может быть и специфичной). А вот кордицепс надо делать либо специально для одного вида (в крайнем случае - рода) муравьев, либо сделать тоже универсальным. Светящийся кордицепс я думал сделать универсальным.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 1927
Рейтинг: 4
ссылка на сообщение  Отправлено: 10.11.19 19:45. Заголовок: Понятно, спасибо за ..


Понятно, спасибо за ответ.
Жду Ваших описаний.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 1596
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 11.11.19 19:55. Заголовок: wovoka Написал две ..


wovoka
Написал две прикидки в теме "Грибы" - паразит насекомых и паразит калатей.
С Bacillus thuringiensis и энтомофторой пока повременим.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 1953
Рейтинг: 4
ссылка на сообщение  Отправлено: 11.11.19 22:57. Заголовок: Биолог пишет: С Bac..


Биолог пишет:

 цитата:
С Bacillus thuringiensis и энтомофторой пока повременим.


Надеюсь, повременим не надолго.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 1600
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 12.11.19 11:28. Заголовок: wovoka Это уж как п..


wovoka
Это уж как получится. Сперва уж фотокордицепс и головню калатей сделаем, а там видно будет.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 2152
Рейтинг: -2
ссылка на сообщение  Отправлено: 06.01.20 19:40. Заголовок: Так-с, вот еще вид ц..


Так-с, вот еще вид цианобактерий, на который меня вдохновило описание Автором ряски схизолемны садовой:

Идею этого вида высказал Автор (Павел Волков)

Анабена схизолемновая (Anabaena schizolemnae)
Тип Цианобактерии (Cyanobacteria)
Семейство Ностоковые (Nostocaceae)

Местообитание: пресные воды, симбионт схизолемны садовой
Некоторые цианобактерии в голоцене вступили в симбиоз с растениями. Получая «приют» от растения, они снабжали его азотом, который фиксировали из окружающей среды. Некоторые виды таких симбионтов, в частности, рода Anabaena, сожительствовали с рясками (Lemna). Их потомки в неоцене изменились сообразно изменениям в строении и жизни рясок.
Схизолемновая анабена претерпела существенные изменения: она имеет две морфологически различные стадии – свободную, живущую в воде, и симбиотическую, живущую в тканях ряски (схизолемны).
Свободная стадия представляет собой длинные нити зеленых бочонковидных клеток, перемежающихся большими круглыми желтоватыми гетероцистами – характерный для предков облик. А симбиотическая стадия имеет вид гетероцисты диаметром около 10 мкм с двумя сине-зелеными фотосинтезирующими клетками по бокам, эти клетки в полтора раза меньше гетероцисты. Такая структура позволяет анабене с максимальной эффективностью снабжать растение азотом, сохраняя при этом собственный фотосинтез. Таких трехклеточных симбионтов в тканях ряски накапливается большое количество, а компактность позволяет равномернее распределяться, придавая симбиотическим тканям схизолемны буровато-зеленый цвет.
Свободная стадия образуется только тогда, когда симбионты по какой-либо причине выпадают из листеца ряски в воду. Вернуться в организм этой же или другой ряски они не могут, а вместо этого делятся, восстанавливая нитевидную структуру, и далее живут независимо. Поскольку такая ситуация достаточно редка, схизолемновая анабена почти не участвует в цветении воды.

Спасибо: 1 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 2134
Рейтинг: 5
ссылка на сообщение  Отправлено: 06.01.20 21:38. Заголовок: Биолог пишет: Анабе..


Биолог пишет:

 цитата:
Анабена схизолемновая


Биолог, спасибо, интересная бактерия.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 2157
Рейтинг: -2
ссылка на сообщение  Отправлено: 07.01.20 12:42. Заголовок: wovoka Спасибо!..


wovoka
Спасибо!

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 2416
Рейтинг: -2
ссылка на сообщение  Отправлено: 29.01.20 19:59. Заголовок: Вот он, симбионт-то:..


Вот он, симбионт-то:

Филантомицет (Philanthomyces antibioticus)
Тип Актинобактерии (Actinobacteria)
Порядок Актиномицеты (Actinomycetales)

Местообитание: леса Фенноскандии, в норах пчелиной рыси
Стрептомицеты (Streptomyces) были одним из основных орудий человека в борьбе с инфекционными болезнями – из них он получал десятки антибиотиков разного спектра действия. Эти нитчатые бактерии производили эритромицин, тетрациклины, левомицетин, нистатин, амфотерицины, неомицин, ванкомицин и множество других антибиотиков, а также другие важные вещества (такролимус, аллозамидин и другие). Представители стрептомицетов вступали в симбиоз с насекомыми – жили в кармашках усиков у самок пчелиного волка (Philanthus triangulum) и защищали его яйца и личинок от почвенных мицелиальных грибов. В неоцене этот симбиоз зашел еще дальше.
Филантомицет – типичный актиномицет. Его клетки имеют вид ветвящихся несептированных нитей, которые делятся на более тонкие субстратные и более толстые воздушные. Воздушные нити образуют густые пучки, а на их концах путем последовательной фрагментации образуются цепочки спор с утолщенной оболочкой. Нити и споры бесцветные, толщина нитей до 1,3 мкм.
Этот вид сожительствует с пчелиной рысью. В карманах усиков самки осы он присутствует в виде спор, которые быстро прорастают на стенках камер гнезда и на добыче – парализованных пчелах. Там образуется тонкий мучнистый налет белого цвета. Выходящая из куколки оса касается усиками налета и собирает в микангии споры.
Основная помощь осе от бактерии состоит в защите: бактерия унаследовала от предков способность выделять антибиотики. Филантомицет выделяет большое количество филантомицина – сильного антигрибного антибиотика с широким спектром действия, производное нистатина. Филантомицин предотвращает рост любых грибов. Поедая добычу с налетом бактерии, личинки осы становятся нечувствительны к поражению грибами, в том числе энтомофторовыми и кордицепсами. Взамен бактерия получает питание – части добычи осы и экскременты и выделения личинки.
Предки этого вида населяли все ниши – почву, поверхность растений, органически загрязненную воду и т. д. Филантомицет же в неоцене, благодаря тесному сожительству, вне нор осы уже не встречается.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 2279
Рейтинг: 6
ссылка на сообщение  Отправлено: 29.01.20 21:24. Заголовок: Биолог пишет: Филан..


Биолог пишет:

 цитата:
Филантомицет


Отлично!
Добавлено в список Ваших видов и в склад идей для новых глав.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 2422
Рейтинг: -2
ссылка на сообщение  Отправлено: 30.01.20 13:05. Заголовок: wovoka Спасибо!..


wovoka
Спасибо!

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 3325
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 05.05.20 18:56. Заголовок: Так-с, с паукообразн..


Так-с, с паукообразными покончили, теперь снова к микробам.
Уже готовлю воскобактерий - потомков микобактерий, совсем потерявших муреин. Еще есть пара-тройка идей, но об этом - позже.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 3331
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 06.05.20 19:06. Заголовок: И вот наши воскобакт..


И вот наши воскобактерии:

Почвенная воскобактерия (Keribacterium terrestris)
Порядок Актиномицеты (Actinomycetales)
Семейство Микобактерии (Mycobacteriaceae)

Местообитание: почва и вода умеренных и тропических зон, организм животных
В эпоху человека микобактерии отличались от остальных бактерий строением клеточной стенки: основная ее масса была представлена миколовыми кислотами, которые в природе встречались только у микобактерий, а также сложными полисахаридами (арабиногалактан, арабиноманнан) и липидами. Миколовые кислоты – разветвленные длинноцепочечные жирные кислоты – делали этих бактерий крайне устойчивыми к высыханию, высокой температуре и химическим реагентам, позволяя им занимать ниши с тяжелыми условиями жизни. Некоторые виды микобактерий были патогенны для человека, например, возбудитель туберкулеза Mycobacterium tuberculosis и возбудитель проказы M. leprae. Количество муреина в клеточных стенках микобактерий было невелико, а в неоцене микобактерии пошли по пути полного отказа от синтеза муреина.
Воскобактерии сохранили морфологию своих предков: это те же длинные тонкие палочки около 1,2 мкм диаметром и до 12-13 мкм длиной. Клеточные стенки толстые, воскообразные (отсюда название), состоят только из миколовых кислот и полисахаридов, муреин отсутствует. Аэробы (хотя могут жить при низких концентрациях кислорода), хемоорганогетеротрофы, мезофилы, неподвижные, спор и капсул не образуют. Устойчивы к соли. Как и предки, имеют корд-фактор (образование шнуровидных агрегатов клеток).
Воскобактерии населяют те же ниши, что и их предки: почву, воду и покровы животных, но уже с более широким диапазоном условий. Они могут разлагать большое количество органических веществ (белки, полисахариды, липиды), а также разлагать вредные для них самих вещества. Выполняют роль почвенных и водных разлагателей, а живущие в организме животных – комменсалы своих хозяев. Почвенная воскобактерия может жить в разных почвах, в том числе сухих, соленых или кислых.
Водная воскобактерия (K. aquaticum) отличается от почвенной образованием толстых липидных слоев на поверхности клетки, что позволяет ей парить в толще воды и легко переноситься течением. Корд-фактор ослаблен. Может жить в воде разной солености, в том числе морской, и разной температуры (как холодной, так и горячей), а также подкисленной.
Кожная воскобактерия (K. cutis) живет на кожных покровах, в ушных слуховых проходах и на наружных половых органах теплокровных животных. Как следствие жизни в благоприятных условиях имеет более тонкую оболочку, но сильный корд-фактор и очень часто – разветвленные клетки.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 9248
Откуда: Канада, Торонто
Рейтинг: 18
ссылка на сообщение  Отправлено: 06.05.20 21:20. Заголовок: Интересные!..


Интересные!

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 2542
Рейтинг: -9

Замечания: Создание клоновТребование внимания от других
ссылка на сообщение  Отправлено: 06.05.20 19:33. Заголовок: А они космополиты? А..


А они космополиты?
А так хорошо.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 3333
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 07.05.20 13:12. Заголовок: Спасибо за отзывы! ..


Спасибо за отзывы!

Фельдфебель
Да, космополиты.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 3396
Рейтинг: 0
ссылка на сообщение  Отправлено: 16.05.20 19:15. Заголовок: Так-с, надо бы еще к..


Так-с, надо бы еще каких-нибудь микроорганизмов в неоцен. Я посмотрю, что можно сделать с паразитами человека и животных.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 3794
Рейтинг: -1
ссылка на сообщение  Отправлено: 26.06.20 18:59. Заголовок: Думаю, можно приоткр..


Думаю, можно приоткрыть тайну: у нас с wovoka в личке было активное обсуждение новой темы - микробиоты "жвачного" желудка лагоморопуса. Мы пришли к выводу, что его желудок такой же, как у коровы: безжелезистые микробные биореакторы (2 или 3) и железистый ферментёр (1). Думаю, можно оставить два безжелезистых отдела с микроорганизмами: рубец и сетку, без книжки обойдемся. Жевание жвачки - в комплекте.
Тогда в рубце будет микробиота, способная переваривать хвойную смолу и жесткие ткани хвои. Вот будущие члены этой микробиоты:
1. Бактерии, разлагающие смолу.
2. Инфузории, поедающие и тоже разлагающие смолу, а также целлюлозу.
3. Грибы - уникальные для лагоморопуса виды, разлагающие целлюлозу и смолу.
Ух, работка...

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 2780
Рейтинг: 6
ссылка на сообщение  Отправлено: 26.06.20 20:01. Заголовок: Биолог пишет: Ух, р..


Биолог пишет:

 цитата:
Ух, работка...


Зато очень интересно!

И сколько микросуществ Вы предполагаете в ЖКТ лагоморопуса поселить?

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 3798
Рейтинг: -1
ссылка на сообщение  Отправлено: 27.06.20 12:15. Заголовок: wovoka Думаю, один ..


wovoka
Думаю, один вид бактерий с 2-3 близкими, столько же инфузорий и грибов.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 2781
Рейтинг: 6
ссылка на сообщение  Отправлено: 27.06.20 15:38. Заголовок: Биолог пишет: Думаю..


Биолог пишет:

 цитата:
Думаю, один вид бактерий с 2-3 близкими, столько же инфузорий и грибов.


Понятно, я думал будет больше, но, полагаю, что и столько сойдёт.

Вы, наверное, видели в википедийной статье Рубец (желудок) есть фраза:

 цитата:
Рубец служит для микробной ферментации пищи. Целлюлоза ферментируется симбиотическими протистами при помощи своих симбиотических внутриклеточных бактерий.


У Вас тоже будут такие симбиотические отношения, когда одна микрокозявка будет жить в клетке другой микрокозявки?

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 3800
Рейтинг: -1
ссылка на сообщение  Отправлено: 27.06.20 17:40. Заголовок: wovoka У Вас тоже б..


wovoka

 цитата:
У Вас тоже будут такие симбиотические отношения, когда одна микрокозявка будет жить в клетке другой микрокозявки?


Ох, вряд ли. Дело в том, что инфузории заглатывают бактерий вместе с частицами корма животного, и эти бактерии и участвуют в пищеварении самой инфузории.

В дополнение к вышеуказанным трем категориям, можно дать архей-метаногенов: они будут обычными морфологически, но жить только в желудке лагоморопуса.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 2784
Рейтинг: 6
ссылка на сообщение  Отправлено: 27.06.20 23:06. Заголовок: Биолог пишет: Ох, в..


Биолог пишет:

 цитата:
Ох, вряд ли.


Понятно!

Биолог пишет:

 цитата:
можно дать архей-метаногенов


Здорово!!!

Как по мне, чем больше существ, тем интересней

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 18013
Откуда: Россия, Москва
Рейтинг: 24
ссылка на сообщение  Отправлено: 28.06.20 06:50. Заголовок: Это просто "анал..


Это просто "аналог коровки", или же у него будут какие-то новые необычные функции?

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 3804
Рейтинг: -1
ссылка на сообщение  Отправлено: 28.06.20 13:17. Заголовок: Мех Переваривание с..


Мех
Переваривание смолы же!

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 18017
Откуда: Россия, Москва
Рейтинг: 24
ссылка на сообщение  Отправлено: 29.06.20 00:48. Заголовок: Биолог пишет: Перева..


Биолог пишет:

 цитата:
Переваривание смолы же!


Сойдёт :3

До речи, я ещё подумал про животное, которое в желудке обволакивает всякие непереваренные частицы специальным твёрдым веществом, чтобы как минимум безболезненно вывести их из организма, как максимум - использовать вместо заглатываемых камней для лучшего перетирания пищи. Может такое быть?

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 3816
Рейтинг: -1
ссылка на сообщение  Отправлено: 29.06.20 12:26. Заголовок: Мех Вряд ли. Как он..


Мех
Вряд ли. Как оно отличит частицы, которые надо обволакивать, от тех, что надо переварить? И вы уверены, что это здесь по теме?

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 18021
Откуда: Россия, Москва
Рейтинг: 24
ссылка на сообщение  Отправлено: 29.06.20 17:44. Заголовок: Биолог пишет: Как он..


Биолог пишет:

 цитата:
Как оно отличит частицы, которые надо обволакивать, от тех, что надо переварить?


Ну, скажем, там живут микроорганизмы, которые в отсутствие желудочного сока начинают вырабатывать вещество?

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 3832
Рейтинг: -1
ссылка на сообщение  Отправлено: 29.06.20 18:24. Заголовок: Мех Желудочный сок ..


Мех
Желудочный сок - очень агрессивная среда для микроорганизмов. Он выделится - они и погибнут.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 3810
Рейтинг: -1
ссылка на сообщение  Отправлено: 28.06.20 18:09. Заголовок: Ну-с, начнем, благос..


Ну-с, начнем, благословясь. Вот бактерии:

Глеоселеномонада терпеновая (Gleoselenomonas terpenovorans)
Отряд Селеномонадовые (Selenomonadales)
Семейство Селеномонадовые (Selenomonadaceae)

Местообитание: бродильные отделы желудка лагоморопуса.
Бактерии рубца занимают важнейшее место в пищеварении жвачных животных с эпохи человека и до неоцена. Они разлагают различные сложные вещества до простых, помогая животному усваивать пищу. Среди них присутствуют самые разные формы: грамположительные и грамотрицательные палочки и кокки, факультативно или облигатно анаэробные. Важное место в таких микробиомах занимали селеномонады – серповидные анаэробные палочки с боковыми жгутиками. В неоцене их потомки претерпели изменения в сложных желудках копытных зайцеобразных – лагоморопусов.
Глеоселеномонады морфологически очень похожи на своих предков: это серповидные палочки около 1,5 × 0,7-0,8 мкм, на вогнутой стороне «серпа» имеется пучок из 3 длинных жгутиков. Клеточная стенка грамотрицательная. Облигатные анаэробы, хемоорганогетеротрофы. Энергию и углерод получают из нового источника – терпенов хвойной смолы. Для переработки терпенов у этого вида имеются ферменты терпеназы. Разлагая терпены, глеоселеномонады помогают лагоморопусу питаться хвоей.
При отрыгивании жвачки бактерии попадают в рот, а оттуда – во внешнюю среду, из которой затем заражаются детеныши лагоморопуса (в частности, общий корм). Размножается этот вид простым делением. В окружающей среде может выживать до нескольких недель.
Глеоселеномонада целлюлозная (Gleoselenomonas cellulovorans) – вид, способный разлагать целлюлозу и пектины из хвои. Имеют ферменты целлюлазы и пектиназы в большом количестве. Морфология, биохимия и пути распространения такие же, как у терпеновой глеоселеномонады, но клетки крупнее – 2,2-2,3 × 1,5-1,7 мкм, имеет 5 жгутиков.

Я старался избегать диссертаций по микробиомам рубца - если это будущая глава, их можно вынести в саму главу. А нет - так добавим позже.

Спасибо: 1 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 2785
Рейтинг: 6
ссылка на сообщение  Отправлено: 29.06.20 15:49. Заголовок: Биолог пишет: Ну-с,..


Биолог пишет:

 цитата:
Ну-с, начнем, благословясь.


С почином

Биолог пишет:

 цитата:
Глеоселеномонада терпеновая
Глеоселеномонада целлюлозная


Крутяк! Мне понравилось!

Биолог пишет:

 цитата:
Я старался избегать диссертаций по микробиомам рубца - если это будущая глава, их можно вынести в саму главу.


Лучше это всё расписать в главе.

Биолог пишет:

 цитата:
в болшом количестве


очепяточка.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 3828
Рейтинг: -1
ссылка на сообщение  Отправлено: 29.06.20 17:11. Заголовок: wovoka Спасибо боль..


wovoka
Спасибо большое! Опечатку сейчас поправлю.

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 3841
Рейтинг: -1
ссылка на сообщение  Отправлено: 30.06.20 17:36. Заголовок: И вот наши археи: М..


И вот наши археи:

Метанобактер лагоморопуса (Methanobacter lagomoropi)
Отряд Метанобактериевые (Methanobacteriales)
Семейство Метанобактерии (Methanobacteriaceae)

Местообитание: бродильные отделы желудка лагоморопуса.
Археи-метаногены были постоянными обитателями рубца и сетки жвачных животных эпохи человека, а также кишечника многих других животных и самого человека в том числе. В бродильном желудке они получали подходящие условия: анаэробиоз и присутствие необходимого им водорода, а метан выделялся в качестве побочного продукта их метаболизма. В неоцене археи освоили новую нишу – рубец лагоморопуса.
Метанобактер лагоморопуса имеет типичную для палочковидных архей морфологию: это длинные и тонкие палочки около 5-6 мкм длиной и 1-2 мкм толщиной. По клетке разбросаны немногочисленные короткие археллумы. Клеточная стенка состоит из белков, защищающих клетку от воздействия кислот, выделяемых бактериями, и агрессивных веществ пищи животного.
Метанобактеры – автотрофы: они используют углекислый газ (CO2) в качестве источника углерода и водород (H2) в качестве переносчика электронов в энергетических цепях. Оба газа вырабатываются живущими здесь же бактериями в ходе брожения сахаров. В качестве побочного продукта метаболизма этих архей выделяется метан (CH4).
Животное не получает от метаногенов прямой пользы – они являются комменсалами, нашедшими подходящие условия. Но они могут переживать условия железистого желудка (сычуга), в который попадают со вторично проглоченной жвачкой. Размножаются метанобактеры делением, со жвачкой попадают в рот и далее заражают детенышей тем же путем, что и инфузории и грибы.

Спасибо: 1 
Профиль Цитата Ответить





Пост N: 2795
Рейтинг: 6
ссылка на сообщение  Отправлено: 30.06.20 19:04. Заголовок: Биолог пишет: Метан..


Биолог пишет:

 цитата:
Метанобактер лагоморопуса



Замечательно

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Прильнувший к микроскопу




Пост N: 3844
Рейтинг: -1
ссылка на сообщение  Отправлено: 01.07.20 11:50. Заголовок: wovoka Спасибо!..


wovoka
Спасибо!

Спасибо: 0 
Профиль Цитата Ответить
Ответов - 114 , стр: 1 2 3 4 5 6 All [только новые]
Ответ:
1 2 3 4 5 6 7 8 9
большой шрифт малый шрифт надстрочный подстрочный заголовок большой заголовок видео с youtube.com картинка из интернета картинка с компьютера ссылка файл с компьютера русская клавиатура транслитератор  цитата  кавычки моноширинный шрифт моноширинный шрифт горизонтальная линия отступ точка LI бегущая строка оффтопик свернутый текст

показывать это сообщение только модераторам
не делать ссылки активными
Имя, пароль:      зарегистрироваться    
Тему читают:
- участник сейчас на форуме
- участник вне форума
Все даты в формате GMT  3 час. Хитов сегодня: 957
Права: смайлы да, картинки да, шрифты да, голосования нет
аватары да, автозамена ссылок вкл, премодерация откл, правка нет