Отправлено: 18.12.10 09:58. Заголовок: Фотосинтезирующие пигменты

В своих проектах многие сталкиваются с проблемой подбора пигмента для растений. попытаюсь облегчить их задачу. Оглавление: 1: хлорофиллы 2: фикобилины 3: каротины 4: связка галофильных бактерий 5: заметки 6: итоги.

 Отправлено: 18.12.10 11:18. Заголовок: Итак: хлорофиллы. Эт..

Итак: хлорофиллы. Это самые распространенные пигменты на Земле. Все они зелёные, самых разных оттенков. Мне известны а-хлорофилл, b-хлорофилл, c-хлорофилл и g-хлорофилл. Разница между ними небольшая, только g-хлорофилл осуществляет анаэробный фотосинтез. Годятся для планет, напоминающих Землю.
А вот и он:
[img][/img]

 Отправлено: 20.06.11 11:42. Заголовок: Это может фотосинтез..

Это может фотосинтезировать:
[img][/img]

 Отправлено: 20.06.11 12:04. Заголовок: Это што у него на во..

Это што у него на востоке, фуллерен? о.о

 Отправлено: 20.06.11 11:45. Заголовок: Что есть «это»?!..

Что есть «это»?!

 Отправлено: 20.06.11 11:48. Заголовок: ропен пишет: Что е..

ропен пишет:

цитата:

Что есть «это»?!

присоединяюсь

 Отправлено: 20.06.11 12:44. Заголовок: Мех пишет: Это што ..

Мех пишет:

цитата:

Это што у него на востоке, фуллерен? о.о

Да. С₆₀.
ропен пишет:

цитата:

Что есть «это»?!

Тривиального названия для данного вещества не существует, а номенклатурное определять адово.

 Отправлено: 20.06.11 12:00. Заголовок: Это тоже: ..

Это тоже:
[img][/img]

 Отправлено: 20.06.11 12:37. Заголовок: Родственное предыдущ..

Родственное предыдущему вещество:
[img][/img]

 Отправлено: 20.06.11 12:52. Заголовок: Вот ещё: ..

Вот ещё:
[img][/img]

 Отправлено: 20.06.11 13:40. Заголовок: В середине зелёного ..

Последнее соединение насыщенно-синего цвета.

 Отправлено: 20.06.11 14:17. Заголовок: А можно всем цвета о..

А можно всем цвета определить? %)

 Отправлено: 20.06.11 20:19. Заголовок: Ну первое - тоже как..

Ну первое - тоже какого-то оттенка синего или голубого. А остальные не знаю.

 Отправлено: 20.06.11 20:21. Заголовок: А вот это хорошая ве..

А вот это хорошая вещь - она из углекислого газа делает угарный:
[img][/img]
Мех, тебе на Аноргу другая биохимия требовалась?

 Отправлено: 23.06.11 17:13. Заголовок: Ещё нашёл: Что цвет..

Ещё нашёл:
[img][/img]
Что цвет немного не тот - простите, глюк Пайнта.

 Отправлено: 24.09.11 17:13. Заголовок: Мне кажется, или это..

Мне кажется, или это аналог порфирина?
[img][/img]

 Отправлено: 24.09.11 18:50. Заголовок: А вот чего спрошу: и..

А вот чего спрошу: из каких пигментов технически можно сделать что-то вроде гемоглобина? У меня есть идея.

 Отправлено: 24.09.11 19:12. Заголовок: Мех пишет: из каких..

Мех пишет:

цитата:

из каких пигментов технически можно сделать что-то вроде гемоглобина?

Вот эта табличка должна быть тебе знакома. =) Если ты имел в виду что-то другое, то поясни.

 Отправлено: 24.09.11 19:22. Заголовок: Да, как раз её я и и..

Да, как раз её я и искал :3 Впрочем, ничего нового она мне уже не дала. Но я имел в виду другое: может ли фотопигмент выполнять при некоторых несложных изменениях (или вообще без них) роль переносчика кислорода?

 Отправлено: 25.09.11 08:51. Заголовок: В основе и гемоглоби..

В основе и гемоглобина и хлорофилла - порфирин или протопорфирин. Так что, сколько влезет.

 Отправлено: 25.09.11 09:17. Заголовок: Это гем - небелковая..

Это гем - небелковая часть гемоглобина:
[img][/img]
Структурка хлорофилла вверху страницы. Называется - найди 10 отличий.

 Отправлено: 25.09.11 09:39. Заголовок: Во, отлично :3 Остал..

Во, отлично :3 Осталось только решить, в каком проекте это реализовывать. Точно не на Васторуме.

 Отправлено: 25.09.11 16:23. Заголовок: Мех пишет: Во, отл..

Мех пишет:

цитата:

Во, отлично :3 Осталось только решить, в каком проекте это реализовывать. Точно не на Васторуме.

На Анорге и на Стали.
Гем бы точно пригодился %)

 Отправлено: 25.09.11 17:33. Заголовок: Неее, я думал что эт..

Неее, я думал что это будет что-то среднее между растением и полипом - такая полупрозрачная хрень с фотосинтезирующей кровью и сменой поколений.

 Отправлено: 26.09.11 07:51. Заголовок: Мех пишет: с фотоси..

Мех пишет:

цитата:

с фотосинтезирующей кровью

Вспомнился почему-то хлороглобин...

 Отправлено: 26.09.11 12:02. Заголовок: Юный биолог пишет: ..

Юный биолог пишет:

цитата:

хлороглобин...

Ня? Формулу можно?

 Отправлено: 26.09.11 17:36. Заголовок: Микроскопическое изу..

Микроскопическое изучение строения листа показывает, что хлорофилл распределен не по всей протоплазме, а сосредоточен в хлоропла-стах. С помощью электронного микроскопа было обнаружено, что внутри хлоропластов имеются еще более мелкие тельца — гранулы, которые и содержат хлорофилл. Помимо хлорофилла в составе хлоропластов обнаружены белки, липиды, углеводы, ферменты, витамины, вещества неорганического происхождения и ряд пигментов, например каротиноиды. Предполагают, что белок в хлоропластах также участвует в фотосинтезе благодаря наличию системы цистин—цистеин (сульф-гидрильные группы — промежуточные переносчики ионов водорода).

Идея о связи хлорофилла с белком принадлежит русским ученым. Еще М. С. Цвет указывал на то, что хлорофилл в пластиде не свободен, а адсорбционно связан с белком. Им был предложен довольно удачный термин — хлороглобин, подчеркивающий сходство между гемоглобином и хлорофилл-белковым комплексом.

Дальнейшие исследования подтвердили это предположение. Для выяснения природы связи хлорофилл — белок изучали спектры комплексов хлорофилла с белками и более простыми пептидами (глицил-лей-цин, пептон, альбумин, протамины). Показано, что молекулы хлорофилла связаны химическими связями с кислотными и основными группами белка. В целом вопрос о типе связи хлорофилл — белок остается пока открытым. Еще нет метода, позволяющего определить точную ориентацию молекул пигмента и других молекул внутри хлоропласта.

 Отправлено: 26.09.11 18:10. Заголовок: А микрозондом щупать..

А микрозондом щупать не пробовали?

 Отправлено: 26.09.11 18:19. Заголовок: Нет... А ЯМР примени..

Нет... А ЯМР применим к белкам?

 Отправлено: 26.09.11 18:23. Заголовок: Мне стыдно. Надо же ..

Мне стыдно. Надо же было так облажаться.
Я хотел сказать "зондовым микроскопом".
Вроде как достаточно острый зонд, позволяет нащупать даже не очень крупные молекулы.

 Отправлено: 18.02.12 17:07. Заголовок: Та фигня с цинком на..

Та фигня с цинком называется цинк-тетрафенилпорфирин, и она синего, почти фиолетового цвета. Самое интересное, что он есть в природе, и не где-нибудь, а в дифтерийной палочке.

 Отправлено: 18.02.12 17:11. Заголовок: Гы!..

 Отправлено: 18.02.12 18:04. Заголовок: Кобоглобин ещё аммон..

Кобоглобин ещё аммоний-ион связывает.

 Отправлено: 19.02.12 17:02. Заголовок: Мех, тот искуственны..

Мех, тот искуственный пигмент с осмием, разлагающийся на свету, оказался с иридием Иридий(I)-хлорокарбонил-бис(трифенилпорфирин)хлорид. Также существует куча таких разностей. Они бесцветны в обоих формах, на свету сначала зеленеют, а потом чернеют. Когда почернели - всё, хана, необратимо.

 Отправлено: 19.02.12 17:36. Заголовок: Занятно %) Док, а ты..

Занятно %) Док, а ты сюда же не только фотопигменты скидываешь?

 Отправлено: 19.02.12 17:39. Заголовок: Как ты наблюдателен(..

Как ты наблюдателен(-: Хотя, нет. Я ведь это всё почерпнул из ссылки, которую тебе дали на Фурахе. Есть ещё коричневый пиннаглобин.

 Отправлено: 19.02.12 18:22. Заголовок: Глаз-алмаз, чо %) За..

Глаз-алмаз, чо %) Забавно, но я по той ссылке ничего внятного понять не смог .D

Предлагаю переименовать тему в "Пигменты" и соответствующим образом разделить на группы всё найденное.

 Отправлено: 20.02.12 15:47. Заголовок: Ага, и красящие тоже..

Ага, и красящие тоже сюда... "Порфириновые и сходные с ними пигменты"?

 Отправлено: 28.02.12 19:57. Заголовок: Гемоглобин вестимент..

Гемоглобин вестиментифер соединяется и с кислородом и с сероводородом, при этом сероводород обратимо связывается с белковой частью молекулы, а кислород — с гемом.

 Отправлено: 28.02.12 22:33. Заголовок: А нормальный, для ср..

А нормальный, для сравнения?

 Отправлено: 29.02.12 18:59. Заголовок: А нормальный просто ..

А нормальный просто кислород.

 Отправлено: 10.03.12 19:51. Заголовок: Люди, никто ни на чт..

Люди, никто ни на что интересное не натыкался?

 Отправлено: 11.06.12 22:45. Заголовок: Я думаю, вам будет и..

Я думаю, вам будет интересно, что в фураханском блоге появилась статья на тему.

 Отправлено: 12.06.12 13:53. Заголовок: И чего там нового?..

И чего там нового?

 Отправлено: 25.06.12 18:44. Заголовок: Как я понял, перенос..

Как я понял, переносить кислород может диоксид церия в наночастицах...

 Отправлено: 31.12.12 14:08. Заголовок: Виолаксантин Превращ..

Виолаксантин

цитата:

Превращение виолаксантина в лютеин с одновременным выделением кислорода зависит от света.

Это то, о чём я подумал?

 Отправлено: 08.01.13 16:23. Заголовок: Каротиноиды, имеющие..

 Отправлено: 07.04.13 17:48. Заголовок: ..

 Отправлено: 07.04.13 18:10. Заголовок: Неплохо так =] Назва..

Неплохо так =] Название у этого вещества есть, или его надо придумать?

 Отправлено: 07.04.13 18:40. Заголовок: Есть, но я его не зн..

Есть, но я его не знаю.

 Отправлено: 07.04.13 18:42. Заголовок: click here..

 Отправлено: 07.04.13 18:48. Заголовок: http://upload.wikime..

 Отправлено: 07.04.13 19:02. Заголовок: У этих гамма красная..

[url=http://en.wikipedia.org/wiki/Tris(bipyridine)ruthenium(II)_chloride]У этих гамма красная.[/url]

 Отправлено: 04.05.13 13:05. Заголовок: Липофусцин — гликоли..

 Отправлено: 04.05.13 13:53. Заголовок: А могут появиться ор..

А могут появиться органоиды, сохраняющие кислород(содержащий липофусцин)?

 Отправлено: 04.05.13 14:00. Заголовок: Я тоже об этом подум..

Я тоже об этом подумал(-:

 Отправлено: 04.05.13 14:15. Заголовок: Если животное облада..

Если животное живет на открытой метности(и много бегает) - то ему такое припособление просто необходимо.

 Отправлено: 23.11.19 00:46. Заголовок: Не фотосинтез, но ок..

Не фотосинтез, но около того: антарктические цианеи вырабатывают особый жёлтый пигмент для защиты от ультрафиолета — сцитонемин.

 Отправлено: 23.11.19 00:51. Заголовок: А тут пишут, что нао..

А тут пишут, что наоборот, поглощает жёлтый: https://www.agroxxi.ru/zhurnal-agroxxi/fakty-mnenija-kommentarii/uchenye-nashli-v-pustyne-okeany-mikrobov-nagrevayuschih-peski.html

 Отправлено: 23.11.19 09:11. Заголовок: Ну, поглощать ещё ма..

Ну, поглощать ещё мало, надо использовать %)

 Отправлено: 24.11.19 15:04. Заголовок: Мех пишет: Ну, погл..

Мех пишет:

цитата:

Ну, поглощать ещё мало, надо использовать %)

Как антенна сойдёт (-:

 Отправлено: 24.11.19 15:57. Заголовок: Кстати, у меня уже м..

Кстати, у меня уже много лет есть мысль применения фотосинтезирующих пигментов для зрения %)

 Отправлено: 24.11.19 16:09. Заголовок: Мех пишет: применен..

Мех пишет:

цитата:

применения фотосинтезирующих пигментов для зрения

Эта идея уже реализована: родопсины млекопитающих сходны с бактериородопсинами.

 Отправлено: 24.11.19 16:11. Заголовок: Это очень отдалённое..

Это очень отдалённое подобие %) Тут речь скорее о листьях, которые могут реально видеть происходящее вокруг.

 Отправлено: 24.11.19 16:43. Заголовок: Мех листьях, которы..

Мех

цитата:

листьях, которые могут реально видеть

Видеть, т. е. получать изображение, можно только мозгом, увы. Нет мозга - обработчика сигнала - нет изображения.

 Отправлено: 24.11.19 16:45. Заголовок: Биолог пишет: Нет м..

Биолог пишет:

цитата:

Нет мозга - обработчика сигнала - нет изображения.

Жду аргумента - триффидов . Но они уж очень фантастичны для нашей Земли...

 Отправлено: 24.11.19 16:48. Заголовок: ник пишет: триффидо..

ник пишет:

цитата:

триффидов

Ага, ага!

 Отправлено: 24.11.19 17:44. Заголовок: Биолог пишет: Видеть..

Биолог пишет:

цитата:

Видеть, т. е. получать изображение, можно только мозгом, увы. Нет мозга - обработчика сигнала - нет изображения.

Таки не только - лягушка, например, может видеть насекомых уже глазом, без обрабатывания информации в мозгу. Не говоря уже о том, что глаза или их функциональные подобия есть даже у заведомо безмозглых кубомедуз и вообще каких-то микроорганизмов.

 Отправлено: 24.11.19 20:25. Заголовок: Мех пишет: Не говор..

Мех пишет:

цитата:

Не говоря уже о том, что глаза или их функциональные подобия есть даже у заведомо безмозглых кубомедуз и вообще каких-то микроорганизмов.

Вы, видимо, всерьез считаете меня неучем от биологии, и уже не впервые. Я знаю про стигмы. Глаза глазами, но световосприятие - это еще не зрение. Глазки (стигмы) у простейших вообще не в кассу. Вот вам цитата о лягушке отсюда:

цитата:

В ходе исследований было обнаружено, что почти 95 % информации поступает в рефлекторный отдел мозга.

Так что увы.

 Отправлено: 24.11.19 22:14. Заголовок: Не буду сейчас об эт..

Не буду сейчас об этом спроить, поскольку изначальная идея в другом - лягушка с листьями вместо глаз что так, что эдак подходит %)

 Отправлено: 26.11.19 08:44. Заголовок: Мне кажется, это в п..

Мне кажется, это в принципе нерационально. Один и тот же пигмент не будет делать две работы хорошо. Скорее уж два специализированных, но похожих, путь синтеза которых совпадает до определённого этапа.

 Отправлено: 26.11.19 10:34. Заголовок: Юный биолог пишет: О..

Юный биолог пишет:

цитата:

Один и тот же пигмент не будет делать две работы хорошо.

Но никто не заставляет его делать две разные работы, вот в чём штука =) Если он поглощает фотон и как-то меняется или производит работу, например выделяет углекислый газ - это можно считать и преобразовать в изображение.

 Отправлено: 26.11.19 11:26. Заголовок: Мех пишет: Если он ..

Мех пишет:

цитата:

Если он поглощает фотон и как-то меняется или производит работу, например выделяет углекислый газ

Это биохимический кошмар. Пигменты, воспринимающие свет, ничего не выделяют, тем более углерод - они же при этом превратятся в другие вещества! Я вам советую почитать про механизм работы сетчатки глаза и механизмы фотосинтеза - и вы многое поймете.

 Отправлено: 26.11.19 12:14. Заголовок: Биолог пишет: Это би..

Биолог пишет:

цитата:

Это биохимический кошмар.

Намана, там всё кошмар =)

цитата:

Пигменты, воспринимающие свет, ничего не выделяют

Но энергию-то они точно выделяют?

 Отправлено: 26.11.19 12:42. Заголовок: Мех пишет: Намана, ..

Мех пишет:

цитата:

Намана, там всё кошмар =)

Ну, в общем, кошмаром я назвал вашу теорию-гипотезу...

цитата:

Но энергию-то они точно выделяют?

Энергию света они поглощают, претерпевая изменения и переводя эту энергию в химическую. Затем тут же возвращаются в исходное состояние.

 Отправлено: 26.11.19 13:13. Заголовок: Биолог пишет: Ну, в ..

Биолог пишет:

цитата:

Ну, в общем, кошмаром я назвал вашу теорию-гипотезу...

Идею, тогда уж +) И что же в ней такого кошмарного? Природа способна почти на любую выдумку.

цитата:

Энергию света они поглощают, претерпевая изменения и переводя эту энергию в химическую. Затем тут же возвращаются в исходное состояние.

Не принципиально, что именно там происходит. Важно лишь то, что пигмент чего-то делает, и это "что-то" можно перевести в сигнал, а сигнал - в картинку.

 Отправлено: 26.11.19 13:25. Заголовок: Мех пишет: Природа ..

Мех пишет:

цитата:

Природа способна почти на любую выдумку.

Ну, глобально - да, но в нашей Вселенной и на нашей планете это ограничено свойствами атомов и молекул, а отсюда - и свойствами сложных веществ.

цитата:

пигмент чего-то делает, и это "что-то" можно перевести в сигнал, а сигнал - в картинку

Прекрасное описание механизма зрения у животных, имеющих глаза и мозг.

 Отправлено: 26.11.19 13:38. Заголовок: Биолог пишет: Прекра..

Биолог пишет:

цитата:

Прекрасное описание механизма зрения у животных, имеющих глаза и мозг.

И-мен-но %)

 Отправлено: 26.11.19 13:24. Заголовок: Биолог пишет: Затем..

Биолог пишет:

цитата:

Затем тут же возвращаются в исходное состояние.

Выделяя при этом энергию в том или ином виде. Сохранение, однако.

 Отправлено: 26.11.19 13:26. Заголовок: Zenitchik пишет: Вы..

Zenitchik пишет:

цитата:

Выделяя при этом энергию в том или ином виде. Сохранение, однако.

И я с этим не спорю. Но это побочный процесс.