Отправлено: 01.01.19 18:27. Заголовок: Неоцен под микроскопом

Я заметил, что в неоцене нет ничего о микроорганизмах.
Какова будет роль бактерий и архей через 25 миллионов лет?
Какие микробиомы почвы, воздуха, морской и пресной воды там будут?
Как выглядит нормальная микробиота неоценовых животных?
Все эти вопросы весьма интересно обсудить.

Предложу несколько идей:
1) Аспороклостридии и аспоробациллы - утратившие спорообразование за ненужностью.
2) Актиноаскомицеты и актинобазидиомицеты - актиномицеты со специализированными органами спороношения.
3) Воскобактерии - заменившие муреин на восковые вещества, потомки микобактерий.
4) Легуминобактерии - живут только в клубеньках бобовых, которые стали большими (как настоящие клубни) и усовершенствовались, а часть симбионтов поднимается по сосудам растения в семязачатки, чтобы передаться потомкам.
5) Новые формы симбионтов в нормальной микробиоте кишечника и других частей тела животных - характерные для каждого вида животного, независимо от "пришельцев" извне, передаваемые детенышам через грудное молоко или яйца.

Это только бактерии, грибы можно и нужно обсуждать отдельно.
В эту же тему можно все, что касается микроорганизмов (кроме грибов-макромицетов) в неоцене.

 Отправлено: 28.10.19 20:11. Заголовок: С археями мало что к..

С археями мало что клеится. Пока есть идея только одного вида, пока фонового, но с потенциалом к взаимосвязям с кем-то еще:

Палочка соляной крови (Halobacterium sanguinisalis)
Тип Эвриархеоты (Euryarchaeota)
Класс Галобактерии (Halobacteria)
Местообитание: гиперсоленые болота Средиземноморской котловины, в воде и на солевых отложениях
В эпоху человека археи (Archaea) населяли разнообразные ниши с экстремальными условиями, главным образом очень высокой температурой, очень высокой кислотностью или концентрациями соли на уровне насыщенной рапы. Такими способностями они обладали благодаря отличиям биохимии от бактерий и эукариот: клеточные стенки у большинства были без муреина и состояли из высокоустойчивых белков, а мембранные липиды имели уникальную структуру, также отличающуюся стойкостью. Их потомки в неоцене сохранили большинство предковых особенностей, но у них появились новые ниши.
Палочка соляной крови обитает в мире соли в Средиземноморской котловине. От своих предков - голоценовых галобактерий - она унаследовала фотосинтез при помощи бактериородопсина, который придавал клеткам предков красный цвет. При этом углерод не ассимилируется, а добывается из других источников. Как и ее предки, она накапливает соли натрия и калия внутри клетки (кристаллы в цитоплазме), чтобы противостоять осмотическому оттоку воды из клетки во внешнюю среду. Но обитание под палящим солнцем привело к новой адаптации: накоплению дополнительных пигментов, защищающих клетку от избытка солнечного ультрафиолета. Эти пигменты придают ромбовидным клеткам этого вида темную красно-фиолетовую окраску, напоминающую венозную кровь человека (отсюда название). Ромбовидные клетки 8-10 мкм в поперечнике плоские и очень тонкие и прилегают гранями друг к другу наподобие аргайла и склеиваются, образуя пластинки из 10-20 штук (размером до 100 мкм). Краевые клетки при этом несут археллумы - видоизмененные архейные жгутики, - благодаря чему вся пластинка может самостоятельно плавать.
Размножаясь в больших количествах, эти организмы вызывают темно-красное с фиолетовым оттенком окрашивание рапы, а также соляных пластов и кристаллов в тех местах, где на них есть достаточное для микроорганизмов количество влаги.
Палочка соляной крови участвует в круговороте фосфора, трансформируя его соединения, а также вступает в симбиоз с нитчатой водорослью Filodunaliella mediterranea, от которой получает углерод в виде глицерина. Нити дюналиеллы при этом часто зацепляются за пластинки галобактерии и плавают вместе с ними.

 Отправлено: 29.10.19 11:44. Заголовок: Описание галобактери..

Описание галобактерии дополнено и подредактировано.

 Отправлено: 29.10.19 12:25. Заголовок: Биолог пишет: Описа..

Биолог пишет:

цитата:

Описание галобактерии дополнено и подредактировано.

И добавлено в список Ваших видов.

Интересное существо.

 Отправлено: 29.10.19 12:37. Заголовок: wovoka Спасибо! Ско..

wovoka
Спасибо! Скоро будет описание той самой водоросли дюналиеллы.

 Отправлено: 29.10.19 13:07. Заголовок: Биолог пишет: Скоро..

Биолог пишет:

цитата:

Скоро будет описание той самой водоросли дюналиеллы.

Ждём.

 Отправлено: 29.10.19 20:26. Заголовок: wovoka пишет: Ждём...

wovoka пишет:

цитата:

Ждём.

Дождались :

Филодюналиелла средиземноморская (Filodunaliella mediterranea)
Отдел Зеленые водоросли (Chlorophyta)
Порядок Хламидомонадные (Chlamydomonadales)
Местообитание: гиперсоленые воды Средиземноморской котловины
В эпоху человека очень немногие водоросли могли жить в гиперсоленой воде. Самым известным родом таких организмов были дюналиеллы (Dunaliella) – одноклеточные подвижные зеленые водоросли, очень похожие на хламидомонад и часто вызывавшие цветение воды. В неоцене их потомки в некоторых новых экологических нишах претерпели заметные изменения.
Филодюналиеллы из одноклеточных стали нитчатыми – они образуют короткие цепочки из 4-5 овальных клеток, заключенных в общую слизисто-маслянистую капсулу. Клетки около 10 мкм в диаметре, нити длиной около 50 мкм, и одна из двух концевых клеток несет полярный пучок жгутиков, вращение которых тянет цепочку клеток вперед.
Каждая клетка, подобно предковым формам, содержит крупный хлоропласт со сферическим пиреноидом и крахмальными зернами, а также большое количество глицерина, который защищает клетку от осмотического влияния рапы. У предков хлорофилл в хлоропласте обычно маскировался большим количеством каротиноидов для защиты от ультрафиолета, придавая клетке красно-оранжевую окраску. У филодюналиеллы их количество снижено – в своем обиталище она прикрыта пластинками палочки соляной крови (Halobacterium sanguinisalis) и часто с ними сцепляется, поэтому ее клетки имеют золотисто-желтый цвет.
Размножается филодюналиелла так же, как и ее предки: митотическим делением, но в неблагоприятных условиях (высыхание, опреснение) клетки внутри цепочки попарно образуют зигоспоры, а оставшиеся без пары гибнут. Зигоспоры имеют толстую стойкую оболочку, позволяющую долго ждать новых подходящих условий, и легко переносятся ветром и животными, чтобы в новых условиях прорасти множеством новых клеток, которые делятся с образованием цепочек.
Выделение филодюналиеллой больших количеств глицерина дает возможность существования галобактериям (источник углерода). При бурном размножении с галобактериями образуется темное кроваво-красное окрашивание, а без галобактерий – золотисто-желтое, в обоих случаях может наблюдаться маслянистость воды из-за глицерина.

 Отправлено: 29.10.19 20:38. Заголовок: Интересно :sm36: ..

Интересно

Биолог пишет:

цитата:

поэтому ее клетки имеют золотисто-желтый цвет.

Может нарисуете? Красиво же.

 Отправлено: 30.10.19 11:31. Заголовок: wovoka пишет: Может..

wovoka пишет:

цитата:

Может нарисуете? Красиво же.

Может быть. Но чуть позже.

 Отправлено: 30.10.19 20:39. Заголовок: А у меня вопрос - ги..

А у меня вопрос - гигантскую одноклеточную водоросль в средиземноморские озера селить будете?

 Отправлено: 31.10.19 11:38. Заголовок: Мамонт Надо же кто ..

Мамонт
Нет, не буду.

 Отправлено: 02.11.19 21:00. Заголовок: Так-с, пришла пора п..

Так-с, пришла пора подумать о дрожжах, выращиваемых муравьями масеуалли, которых описал wovoka.
Сделаем так:

Муравьиные дрожжи (Myrmecomyces macehuallii)
Отдел Аскомицеты (Ascomycota)
Класс Сахаромицеты (Saccharomycetes)
Местообитание: исключительно в колониях почтека при уходе со стороны масеуалли.

 Отправлено: 02.11.19 22:19. Заголовок: Биолог пишет: пора ..

Биолог пишет:

цитата:

пора подумать о дрожжах, выращиваемых муравьями масеуалли

Там точно указана предковая форма Tyridiomyces formicarum
И перенесу сюда важную информацию из описания дрожжей: Дрожжи Tyridiomyces formicarum для своего развития нуждаются в растительном компосте, смешанном с субстратом из измельченных насекомых, а также в удобрениях из фекалий гусениц-лепидоптер.
А в остальном с нетерпением жду Вашего описания.

 Отправлено: 03.11.19 16:00. Заголовок: wovoka Спасибо, я у..

wovoka
Спасибо, я уже проверял, что это за предок. Сахаромицет и есть. Описанный субстрат - это смесь сахаров (компост и помет гусениц) и белков (измельченные насекомые), все закономерно. В неоцене вполне может быть примерно также. А вот название сделаем покрасивше:

"Муравьиный янтарь", масеуалломицет (Macehuallomyces myrmecophilus)
Отдел Аскомицеты (Ascomycota)
Класс Сахаромицеты (Saccharomycetes)
Местообитание: исключительно в колониях почтека при уходе со стороны масеуалли
В эпоху человека дрожжи - одноклеточные грибы - были в основном сапрофитами и комменсалами, хотя некоторые вызывали опасные болезни (Candida, Cryptococcus). Дрожжи были разнородной сборной группой грибов из трех отделов (аскомицетов, базидиомицетов и дейтеромицетов) и в природе обитали в почве, воде и на растениях. Но некоторые формы перешли к жизни в гнездах муравьев на подготавливаемых муравьями субстратах, и при этом служили муравьям пищей. Так, вид Tyridiomyces formicarum из числа сахаромицетовых аскомицетов жил в гнездах муравья Cyphomyrmex rimosus, и в неоцене потомки этого муравья продолжают культивировать потомков этого вида дрожжей.
"Муравьиный янтарь" по-прежнему имеет характерную для дрожжей-сахаромицетов морфологию: овальные или яйцевидные клетки в среднем 7-8 × 25-30 мкм, размножающиеся почкованием. Почек на одной клетке образуется много - до десятка, и часто в одной плоскости. При этом почки не отделяются сразу от материнской клетки и могут давать вторичные почки, а те - третичные и т. д. Это приводит к образованию веерообразных или дискообразных древовидно ветвящихся агрегатов клеток. Часто такие агрегаты растут в высоту. Такой рост приводит к покрытию субстрата творожистым слегка просвечивающим налетом чистой культуры гриба толщиной около 0,5 см.
Благодаря хорошему уходу со стороны муравьев (подготовка субстратов и очистка от загрязнений) масеуалломицет процветает и синтезирует много веществ, необходимых для питания муравьев. В числе этих веществ много каротиноидов, поэтому клетки и образуемый ими налет имеют янтарно-оранжевый цвет - отсюда название вида. А синтез полисахаридов и белков создает творожистость и даже хрящеватость культуры.
В условиях, созданных муравьями, "муравьиный янтарь" не нуждается в спорообразовании, но при разрушении гнезда животными-мирмекофагами все же может их лишиться. В этом случае агрегаты клеток распадаются. Клетки покрываются плотной толстой оболочкой и делятся редукционным делением внутри оболочки с образованием 4 аскоспор, а общая оболочка материнской клетки играет роль аска (сумки). В таком виде аск со спорами может жить достаточно долго, чтобы дождаться восстановления гнезда муравьями и снова получить необходимый уход. Тогда он прорастет и даст начало новому поколению, клетки которого вступают в конъюгацию, чтобы восстановить диплоидность, и снова почкуются.

 Отправлено: 03.11.19 16:19. Заголовок: Замечательное описан..

Замечательное описание!!!
Спасибо огромное!!!
Сейчас добавлю в список Ваших видов!!!

 Отправлено: 10.11.19 14:00. Заголовок: Что-то не клеится у ..

Что-то не клеится у меня ничего с насекомыми, ничего путного не приходит в голову.
Но зато идеи новых микроорганизмов рождаются быстро. Вот прикидки:
1. Потомок Bacillus thuringiensis - знаменитой инсектицидной палочки, взятой на вооружение человеком. Надо ему придумать новые свойства (точнее, ее знаменитому токсину) и новых хозяев.
2. Потомок голоценовой энтомофторы - белопузырчатая головня насекомых. Название - от сходства с пузырчатой головнёй злаков (вызываемой устилаговыми грибами).
3. Ржавчина насекомых - тоже потомок энтомофторы, но название от сходства с ржавчиной злаков (вызываемой пукциниевыми грибами).
4. Светящийся кордицепс - потомок кордицепсов, научившийся светиться для привлечения ночных насекомых.

 Отправлено: 10.11.19 15:14. Заголовок: Задумки интересные. ..

Задумки интересные. Эти твари будут вызывать болезни у муравьёв?

 Отправлено: 10.11.19 17:22. Заголовок: Биолог пишет: Ржавчи..

Биолог пишет:

цитата:

Ржавчина насекомых

ГГГшненько %)

цитата:

Светящийся кордицепс - потомок кордицепсов, научившийся светиться для привлечения ночных насекомых.

Насколько мне известно, свет их не приманивает, а сбивает навигацию по звёздному свету, меняя траекторию с прямой на спиральную.

 Отправлено: 10.11.19 19:21. Заголовок: wovoka Задумки инте..

wovoka

цитата:

Задумки интересные. Эти твари будут вызывать болезни у муравьёв?

Да, конечно! Кордицепс же.

Мех

цитата:

ГГГшненько %)

Ага! Но ведь и ржавчина пшеницы - тоже прикольно звучит, но является официальным названием болезни этого злака - по сходству цвета бесполого спороношения гриба (в виде пятен на листьях и стеблях) с окислами железа.

цитата:

Насколько мне известно, свет их не приманивает, а сбивает навигацию по звёздному свету, меняя траекторию с прямой на спиральную.

Есть несколько гипотез. Но вы говорите о механизме, результат которого ясен - прилет к источнику света.

 Отправлено: 10.11.19 19:29. Заголовок: Биолог пишет: Да, к..

Биолог пишет:

цитата:

Да, конечно! Кордицепс же.

А у почтека или конкистадоров, или у обоих?

 Отправлено: 10.11.19 19:42. Заголовок: wovoka пишет: А у п..

wovoka пишет:

цитата:

А у почтека или конкистадоров, или у обоих?

Энтомофтора - у всех подряд, она не очень специфична (хотя может быть и специфичной). А вот кордицепс надо делать либо специально для одного вида (в крайнем случае - рода) муравьев, либо сделать тоже универсальным. Светящийся кордицепс я думал сделать универсальным.